More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1972 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  100 
 
 
250 aa  500  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  60.24 
 
 
249 aa  282  3e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  55.42 
 
 
249 aa  275  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  58.1 
 
 
253 aa  266  3e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  59.35 
 
 
248 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  57.32 
 
 
248 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  53.75 
 
 
250 aa  253  2e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  54.15 
 
 
253 aa  253  2e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  56.05 
 
 
251 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 
248 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  48.05 
 
 
260 aa  249  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.4878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.71764e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.57421e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
256 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.76569e-08  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21721e-05  unclonable  5.28037e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  248  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.78614e-07  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  248  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.72651e-05  hitchhiker  5.21404e-05 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  55.74 
 
 
251 aa  248  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 
251 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.08196e-06  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  48.44 
 
 
260 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  55.91 
 
 
249 aa  247  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  54.72 
 
 
251 aa  246  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  47.27 
 
 
260 aa  245  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.92621e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  47.66 
 
 
260 aa  245  5e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  4.96067e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  48.26 
 
 
260 aa  244  9e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.64415e-05  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  55.82 
 
 
245 aa  244  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 
251 aa  244  1e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.00734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  47.86 
 
 
260 aa  244  1e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.37173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 
251 aa  244  1e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  54.72 
 
 
246 aa  243  2e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  53.78 
 
 
270 aa  243  2e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  47.27 
 
 
260 aa  243  2e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  4.2953e-06  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 
251 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 
251 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  7.85898e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  53.94 
 
 
251 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  53.04 
 
 
248 aa  238  7e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  52.46 
 
 
251 aa  238  7e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 
253 aa  238  8e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  2.44559e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 
245 aa  237  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 
251 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 
251 aa  237  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  54.33 
 
 
266 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  46.59 
 
 
249 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  55.56 
 
 
258 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  56.57 
 
 
259 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  50 
 
 
251 aa  235  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  49.01 
 
 
250 aa  235  5e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  52.61 
 
 
247 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  52.16 
 
 
255 aa  234  1e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  55.38 
 
 
259 aa  233  1e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 
250 aa  233  2e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  53.36 
 
 
261 aa  233  2e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  50.59 
 
 
261 aa  233  2e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 
250 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  54.62 
 
 
248 aa  232  4e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  57.14 
 
 
245 aa  232  4e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 
251 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 
251 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  55.83 
 
 
255 aa  231  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  51 
 
 
251 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  55.12 
 
 
266 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  55.12 
 
 
266 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  55.12 
 
 
266 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
250 aa  231  9e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  55.12 
 
 
266 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  55.12 
 
 
251 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  51.78 
 
 
256 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  8.20066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  55.12 
 
 
251 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  52.57 
 
 
272 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  8.34169e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 
255 aa  228  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
250 aa  228  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
255 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
255 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
255 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
255 aa  228  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01687  triosephosphate isomerase  51.45 
 
 
232 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000150844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  50.58 
 
 
262 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  50.79 
 
 
256 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3078  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 
249 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  53.54 
 
 
251 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  50.99 
 
 
257 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  49.03 
 
 
260 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  47.99 
 
 
287 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 
249 aa  225  5e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50.81 
 
 
250 aa  225  5e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  48 
 
 
255 aa  225  5e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  51.57 
 
 
263 aa  225  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  48 
 
 
271 aa  224  7e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  47.83 
 
 
252 aa  224  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
255 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
255 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
265 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
255 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 
255 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
255 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
255 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>