More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1950 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  63.01 
 
 
151 aa  189  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  48.99 
 
 
152 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  48.99 
 
 
152 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  48.34 
 
 
158 aa  150  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  46.98 
 
 
153 aa  147  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  53.52 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  48.95 
 
 
153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  51.37 
 
 
150 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  52.82 
 
 
151 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  49.66 
 
 
169 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  49.66 
 
 
169 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  49.66 
 
 
152 aa  143  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  49.65 
 
 
154 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  49.66 
 
 
152 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  48.99 
 
 
169 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  43.79 
 
 
173 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  47.33 
 
 
151 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  45.03 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  47.55 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  45.7 
 
 
153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  44.59 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  45.52 
 
 
161 aa  137  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  44.22 
 
 
152 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  44.22 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  45.64 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  45.64 
 
 
158 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  45.58 
 
 
151 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  42.59 
 
 
165 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  42.68 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  45.03 
 
 
153 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  43.37 
 
 
191 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  43.62 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  44.97 
 
 
151 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  42.95 
 
 
151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  43.14 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  42.95 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  42.95 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  47.1 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  42.47 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  128  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  46.1 
 
 
154 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  46.31 
 
 
150 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  42.95 
 
 
151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  42.95 
 
 
151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  42.95 
 
 
151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  42.95 
 
 
151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  44.97 
 
 
154 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  45.64 
 
 
154 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  45.64 
 
 
154 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  45.64 
 
 
150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  45.64 
 
 
154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  45.64 
 
 
150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  45.64 
 
 
150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  41.61 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  46.76 
 
 
140 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  45.64 
 
 
154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  44.97 
 
 
150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  43.18 
 
 
154 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  43.62 
 
 
150 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  45.7 
 
 
161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  47.48 
 
 
140 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  46.98 
 
 
159 aa  124  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  46.76 
 
 
140 aa  123  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1690  hypothetical protein  50 
 
 
144 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  40.65 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  46.94 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  46.45 
 
 
162 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  38.1 
 
 
152 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  44.67 
 
 
224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  46.85 
 
 
142 aa  117  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  43.54 
 
 
262 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  49.63 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  43.45 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  44.52 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  40.94 
 
 
263 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0699  hypothetical protein  45.77 
 
 
161 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.188397  normal  0.319675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  45.77 
 
 
260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  45.51 
 
 
203 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  40.14 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  41.14 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  42.86 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>