More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1862 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  100 
 
 
292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  69.86 
 
 
291 aa  417  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  62.46 
 
 
293 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  64.85 
 
 
293 aa  360  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  61.72 
 
 
292 aa  360  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  61.3 
 
 
289 aa  351  7e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  60.75 
 
 
294 aa  350  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  59.86 
 
 
292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  59.52 
 
 
292 aa  336  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  56.6 
 
 
290 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  55.94 
 
 
294 aa  304  9.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  54.33 
 
 
302 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  54.83 
 
 
285 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  56.38 
 
 
290 aa  300  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  55.48 
 
 
292 aa  299  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.79 
 
 
289 aa  299  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  55.48 
 
 
285 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  55.48 
 
 
285 aa  298  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  55.48 
 
 
285 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  54.48 
 
 
285 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  53.38 
 
 
292 aa  295  9e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  53.38 
 
 
292 aa  295  9e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  52.19 
 
 
291 aa  289  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  51.96 
 
 
290 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  52.5 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  52.86 
 
 
292 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  52.14 
 
 
293 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  52.41 
 
 
283 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  50.51 
 
 
291 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  51.79 
 
 
294 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  49.83 
 
 
296 aa  279  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  49.83 
 
 
296 aa  279  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  51.79 
 
 
293 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  51.79 
 
 
293 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  51.79 
 
 
293 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  51.79 
 
 
293 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  51.79 
 
 
293 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  51.79 
 
 
293 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  50 
 
 
293 aa  278  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  53.1 
 
 
283 aa  278  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  52.76 
 
 
283 aa  277  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  50.36 
 
 
293 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  50 
 
 
293 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  51.79 
 
 
292 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  55.48 
 
 
292 aa  276  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  56.18 
 
 
283 aa  275  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  49.64 
 
 
293 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  49.64 
 
 
293 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  49.64 
 
 
293 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  49.64 
 
 
293 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  49.64 
 
 
293 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  50 
 
 
293 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  49.82 
 
 
291 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  51.89 
 
 
286 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  51.25 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  51.72 
 
 
283 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  50 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  54.79 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  51.38 
 
 
283 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  49.47 
 
 
294 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  54.17 
 
 
282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  49.83 
 
 
291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  51.07 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  48.47 
 
 
296 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  50.89 
 
 
289 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  48.93 
 
 
292 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  50.17 
 
 
287 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  47.31 
 
 
290 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  51.25 
 
 
287 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  48.26 
 
 
287 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  48.26 
 
 
287 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  50 
 
 
298 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  50 
 
 
298 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  51.6 
 
 
306 aa  255  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  48.86 
 
 
310 aa  255  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  46.56 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.26 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  51.36 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  55.07 
 
 
283 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  51.19 
 
 
293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  51.19 
 
 
293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  45.33 
 
 
311 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  50.34 
 
 
292 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  49.65 
 
 
298 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  48 
 
 
307 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  49.65 
 
 
298 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  49.3 
 
 
294 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>