230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1847 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
130 aa  254  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.8 
 
 
134 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0439  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 
132 aa  83.2  1e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.29268  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
135 aa  72  3e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 
137 aa  70.5  7e-12  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  35.61 
 
 
143 aa  67.8  5e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
140 aa  67  8e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.33 
 
 
136 aa  64.7  4e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
140 aa  64.7  4e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.091049  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 
137 aa  64.3  5e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
158 aa  63.5  8e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  37.19 
 
 
134 aa  63.2  1e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
134 aa  62.8  1e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  27.64 
 
 
133 aa  62  2e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
132 aa  62.4  2e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  38.33 
 
 
142 aa  62.8  2e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  33.64 
 
 
146 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.17 
 
 
141 aa  61.2  4e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.19 
 
 
134 aa  61.6  4e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.07 
 
 
136 aa  60.5  7e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 
149 aa  60.5  7e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  32.73 
 
 
146 aa  60.5  8e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.76 
 
 
136 aa  60.5  8e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 
133 aa  60.1  9e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 
133 aa  60.1  9e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.31 
 
 
136 aa  59.7  1e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
134 aa  60.1  1e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  4.57301e-05 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.69 
 
 
135 aa  59.3  2e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.82 
 
 
143 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.17 
 
 
142 aa  58.5  3e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
142 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  31.82 
 
 
143 aa  58.2  4e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
140 aa  58.2  4e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
139 aa  57.4  6e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  31.03 
 
 
137 aa  57  8e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  25.2 
 
 
136 aa  57  8e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 
134 aa  56.2  1e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  1.53595e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
134 aa  57  1e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  29.37 
 
 
135 aa  56.2  1e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  1.82227e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  26.72 
 
 
134 aa  57  1e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1852  biopolymer transport exbD protein  31.86 
 
 
136 aa  56.2  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
134 aa  55.8  2e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
134 aa  55.8  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.03 
 
 
155 aa  55.8  2e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 
134 aa  56.2  2e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 
134 aa  55.1  3e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  6.99577e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 
134 aa  55.1  3e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 
134 aa  55.1  3e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
134 aa  55.1  3e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 
134 aa  55.1  3e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 
141 aa  55.1  3e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  31.09 
 
 
148 aa  55.1  4e-07  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
143 aa  54.7  4e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
133 aa  54.7  5e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  27.78 
 
 
134 aa  54.7  5e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.94 
 
 
141 aa  53.9  6e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
134 aa  54.3  6e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  2.46582e-05 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.94 
 
 
141 aa  53.9  6e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
134 aa  54.3  6e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  4.63213e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
134 aa  54.3  6e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  1.06541e-06 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  27.59 
 
 
132 aa  54.3  6e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2615  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
218 aa  53.9  8e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 
140 aa  53.5  8e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.364458  normal  0.851984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  25.86 
 
 
135 aa  53.9  8e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
141 aa  53.9  8e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.37 
 
 
141 aa  53.9  8e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 
134 aa  53.5  8e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.82 
 
 
140 aa  53.5  9e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.21 
 
 
134 aa  53.5  1e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.43 
 
 
122 aa  52.8  1e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
142 aa  53.1  1e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.6 
 
 
127 aa  53.1  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
141 aa  52.4  2e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 
134 aa  52.4  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  23.28 
 
 
135 aa  52.4  2e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  26.27 
 
 
134 aa  52.4  2e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  25 
 
 
134 aa  52.4  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.62 
 
 
138 aa  52.4  2e-06  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.74903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 
142 aa  52.4  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.23 
 
 
142 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
141 aa  52.4  2e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  28.23 
 
 
143 aa  52  3e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
140 aa  52  3e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  26.72 
 
 
143 aa  52  3e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
141 aa  51.6  4e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  29.2 
 
 
147 aa  51.6  4e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.79 
 
 
135 aa  51.6  4e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  29.23 
 
 
145 aa  51.2  5e-06  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
140 aa  51.2  5e-06  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 
143 aa  50.8  5e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 
145 aa  51.2  5e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  25 
 
 
134 aa  50.4  7e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.41 
 
 
135 aa  50.4  8e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.59 
 
 
128 aa  50.4  8e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.67 
 
 
140 aa  50.4  9e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2485  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 
141 aa  49.7  1e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  5.40401e-11  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  30.25 
 
 
139 aa  49.7  1e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>