More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1846 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1846  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
134 aa  261  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108397  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.6 
 
 
134 aa  90.5  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.88 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  32 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  31.4 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.45 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  26.56 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  28.03 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  27.43 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.05 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1436  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.84 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4087  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.8 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0244495  normal  0.590384 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.56 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.62 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.53 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  28.57 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.95 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.59 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.78 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.09 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.46 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.66 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.22 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.66 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  24.81 
 
 
136 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.95 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.58 
 
 
133 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.03 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  30.47 
 
 
148 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  33.61 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  25 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.23 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  35.19 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.79 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.27 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  35.54 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  33.05 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.33 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0184  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0748  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  32.77 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  24.81 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.27 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  34.26 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  31.2 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  36.13 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.77 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.21 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  35.04 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2417  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.978308  normal  0.103563 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0487  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.181601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.85 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  37.6 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  26.09 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.86 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  28.89 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  32.79 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3332  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.67 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156003  normal  0.605878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.03 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.44 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>