More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1826 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  100 
 
 
264 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  49.61 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  44.91 
 
 
261 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  46.93 
 
 
295 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  45.53 
 
 
296 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  44.53 
 
 
315 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  46.72 
 
 
296 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  46.72 
 
 
296 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.93 
 
 
304 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  43.67 
 
 
257 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  41.98 
 
 
311 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  46.49 
 
 
295 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  46.96 
 
 
292 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  42.5 
 
 
312 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  43.59 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  43.86 
 
 
294 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  42.41 
 
 
301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  40 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  35.38 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  42.8 
 
 
296 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  42.8 
 
 
298 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  42.8 
 
 
296 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  42.8 
 
 
296 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  44.35 
 
 
292 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  42.8 
 
 
296 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  42.8 
 
 
296 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  41.28 
 
 
318 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  42.8 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  35.06 
 
 
307 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  40.43 
 
 
265 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  39.58 
 
 
289 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  38.32 
 
 
261 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  42.61 
 
 
292 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  43.81 
 
 
268 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  40.76 
 
 
262 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  40.76 
 
 
262 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  43.51 
 
 
295 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  44.83 
 
 
298 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40.29 
 
 
287 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  42.31 
 
 
299 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  36.5 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  38.08 
 
 
285 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44.54 
 
 
293 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  38.26 
 
 
290 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  42.04 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  43.67 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  42.35 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  44.84 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  38.08 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  39.38 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  39.38 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  40 
 
 
317 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  32.99 
 
 
285 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  41.83 
 
 
292 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  37.07 
 
 
260 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  39.69 
 
 
238 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  43.1 
 
 
293 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  43.3 
 
 
240 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  43.36 
 
 
274 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  41.49 
 
 
288 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  41.18 
 
 
274 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  37.13 
 
 
311 aa  158  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  36.76 
 
 
310 aa  158  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  40.78 
 
 
315 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  42.67 
 
 
233 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  38.15 
 
 
294 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.67 
 
 
233 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.67 
 
 
233 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.67 
 
 
233 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  33.33 
 
 
298 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  36.65 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  43.15 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  42.86 
 
 
296 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.86 
 
 
296 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  38.38 
 
 
285 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  39.38 
 
 
327 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  39.38 
 
 
327 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  41.59 
 
 
230 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  34 
 
 
298 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  37.87 
 
 
311 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  34 
 
 
298 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  37.64 
 
 
296 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  42.86 
 
 
236 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.08 
 
 
288 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  34.87 
 
 
307 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  36.6 
 
 
296 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  40.09 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  40.47 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  36.65 
 
 
298 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  34.42 
 
 
298 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  38.61 
 
 
327 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  37.45 
 
 
328 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  35.83 
 
 
298 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  35.83 
 
 
298 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  36.05 
 
 
379 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  36.05 
 
 
379 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  36.05 
 
 
363 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  35.64 
 
 
333 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  36.05 
 
 
379 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  40.51 
 
 
295 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>