218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1728 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  68.7 
 
 
476 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  65.34 
 
 
476 aa  642    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  66.18 
 
 
476 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  956    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  71.22 
 
 
476 aa  671    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  67.09 
 
 
477 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  69.12 
 
 
476 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  66.6 
 
 
476 aa  615  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  67.86 
 
 
476 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  61.43 
 
 
477 aa  598  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  61.13 
 
 
475 aa  585  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  58.82 
 
 
477 aa  580  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  59.87 
 
 
476 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  52.31 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  51.57 
 
 
482 aa  462  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  49.38 
 
 
493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  50 
 
 
500 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  48.95 
 
 
474 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  49.58 
 
 
484 aa  451  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  48.96 
 
 
486 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  49.37 
 
 
474 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  52.3 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  50.11 
 
 
478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  47.6 
 
 
480 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  49.38 
 
 
485 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  49.16 
 
 
477 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  47.81 
 
 
480 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  49.58 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  48.02 
 
 
486 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  48.02 
 
 
486 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  48.54 
 
 
486 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  51.27 
 
 
473 aa  437  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  48.44 
 
 
485 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  51.69 
 
 
486 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  45.51 
 
 
480 aa  435  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  47.5 
 
 
480 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  50 
 
 
481 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  49.16 
 
 
478 aa  433  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  48.66 
 
 
484 aa  435  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  47.51 
 
 
485 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  48.35 
 
 
498 aa  431  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  45.72 
 
 
482 aa  426  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  48.85 
 
 
486 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  48.32 
 
 
477 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  46.96 
 
 
460 aa  424  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  47.42 
 
 
484 aa  424  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  45.13 
 
 
472 aa  422  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  47.17 
 
 
486 aa  421  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  55.2 
 
 
432 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  46.35 
 
 
486 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  47.22 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  51.04 
 
 
484 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  45.17 
 
 
482 aa  413  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  46.97 
 
 
486 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  44.16 
 
 
443 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  48.53 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  45.4 
 
 
477 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  45.53 
 
 
488 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  54 
 
 
465 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  45.87 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  52.59 
 
 
472 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  52.37 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  49.69 
 
 
479 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  45.74 
 
 
484 aa  396  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  49.49 
 
 
487 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  43.51 
 
 
502 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  48.96 
 
 
488 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  49.17 
 
 
487 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  47.17 
 
 
514 aa  378  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  52.95 
 
 
475 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  50.9 
 
 
988 aa  359  5e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  43.82 
 
 
473 aa  345  8e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  42.71 
 
 
963 aa  343  5e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  42.17 
 
 
473 aa  332  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  37.42 
 
 
447 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  39.41 
 
 
462 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  30.13 
 
 
451 aa  202  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  33.33 
 
 
395 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  30.14 
 
 
396 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  33.26 
 
 
398 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  32.05 
 
 
402 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  33.4 
 
 
511 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  31.73 
 
 
395 aa  152  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  31.48 
 
 
394 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  29.31 
 
 
514 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  33.41 
 
 
395 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  32.95 
 
 
397 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  30.02 
 
 
410 aa  150  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  30.74 
 
 
398 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  31.38 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  31.75 
 
 
407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  31.1 
 
 
398 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  27.33 
 
 
393 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  30.77 
 
 
399 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  31.61 
 
 
406 aa  143  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  30.88 
 
 
384 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  30.84 
 
 
411 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  30 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  30.11 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  29.21 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>