189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1678 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1678  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  100 
 
 
196 aa  408  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.184526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1875  NapC/NirT cytochrome c-like  48.33 
 
 
391 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1283  membrane-bound tetrahaem cytochrome TorC/YecK  45.6 
 
 
392 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4034  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  40 
 
 
394 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4155  cytochrome c-type protein torC  40 
 
 
394 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4051  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  40 
 
 
394 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4213  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  40 
 
 
394 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4106  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  39.47 
 
 
394 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1587  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  42.78 
 
 
196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2646  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  40.41 
 
 
390 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1232  cytochrome c-type protein torC  40.41 
 
 
390 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1113  cytochrome c-type protein torC  40.41 
 
 
390 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2599  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  40.41 
 
 
390 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1107  cytochrome c-type protein torC  40.41 
 
 
390 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2128  cytochrome c-type protein torC  40.41 
 
 
390 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1504  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  40.74 
 
 
203 aa  162  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2481  cytochrome c-type protein NapC  42.49 
 
 
200 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2439  cytochrome c-type protein NapC  42.49 
 
 
200 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.568439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2495  cytochrome c-type protein NapC  42.49 
 
 
200 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00306548 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2598  cytochrome c-type protein NapC  42.49 
 
 
200 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.374466 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2390  cytochrome c-type protein NapC  42.49 
 
 
200 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00999  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c-type subunit  39.9 
 
 
390 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3513  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  42.22 
 
 
215 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.654609  normal  0.0192355 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01006  hypothetical protein  39.9 
 
 
390 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1915  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  44.74 
 
 
196 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000371882  normal  0.91066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2579  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  40.66 
 
 
191 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123088  normal  0.367368 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0619  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  42.62 
 
 
191 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05375  cytochrome c-type protein NapC  44.57 
 
 
192 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1339  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  40.31 
 
 
233 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3046  DMSO/TMAO pentaheme cytochrome c subunit  42.86 
 
 
392 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3773  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  42.86 
 
 
392 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3161  cytochrome c-type protein NapC  42.6 
 
 
237 aa  154  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1389  cytochrome c-type protein NapC  39.69 
 
 
199 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.701394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2788  cytochrome c-type protein NapC  39.69 
 
 
200 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1275  cytochrome c-type protein NapC  39.69 
 
 
199 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1539  cytochrome c-type protein YecK  44.97 
 
 
368 aa  151  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2609  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  41.38 
 
 
366 aa  151  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.637408  hitchhiker  0.00703853 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000515  cytochrome c-type protein NapC  48.39 
 
 
170 aa  150  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1448  cytochrome c-type protein NapC  40.51 
 
 
200 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02129  nitrate reductase, cytochrome c-type, periplasmic  40.51 
 
 
200 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268616  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1457  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  40.51 
 
 
200 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2415  cytochrome c-type protein NapC  38.5 
 
 
200 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2501  cytochrome c-type protein NapC  40.51 
 
 
200 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0739  cytochrome c-type protein NapC  40.51 
 
 
200 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1749  NapC/NirT cytochrome c-like  47.02 
 
 
385 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.154925 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3339  cytochrome c-type protein NapC  40.51 
 
 
200 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2340  cytochrome c-type protein NapC  40.51 
 
 
200 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4005  NapC/NirT cytochrome c domain protein  42.69 
 
 
206 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02088  hypothetical protein  40.51 
 
 
200 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.254061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2350  cytochrome c-type protein NapC  40.51 
 
 
200 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1313  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  46.81 
 
 
366 aa  148  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.563249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3218  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.54 
 
 
234 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3232  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  47.14 
 
 
386 aa  148  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000448194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2719  cytochrome c-type protein NapC  38.5 
 
 
200 aa  147  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1017  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  39.89 
 
 
204 aa  147  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0773  cytochrome c-type protein  37.82 
 
 
392 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2166  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  46.81 
 
 
366 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1759  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  46.81 
 
 
366 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1968  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  46.81 
 
 
366 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3525  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  39.44 
 
 
392 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2364  cytochrome c-type protein NapC  42.44 
 
 
191 aa  145  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1767  NapC/NirT cytochrome c domain protein  46.1 
 
 
366 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.936098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2105  trimethylamine N-oxide reductase III, c-type cytochrome subunit TorY  46.1 
 
 
366 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000872  cytochrome c-type protein TorY  43.9 
 
 
364 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2172  nitrate reductase periplasmic cytochrome c-type protein NapC  38.86 
 
 
191 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.457152  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01844  TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c-type subunit  46.1 
 
 
366 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2617  NapC/NirT cytochrome c domain protein  39.57 
 
 
203 aa  144  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.245408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01833  hypothetical protein  46.1 
 
 
366 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5182  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  38.73 
 
 
233 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1055  cytochrome c-type protein NapC  39.44 
 
 
195 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1832  cytochrome c-type protein TorC  37.5 
 
 
392 aa  143  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1338  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  38.22 
 
 
202 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1297  cytochrome c-type protein TorC  38.17 
 
 
394 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0954  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome, NapC/NirT  38.22 
 
 
212 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.448088 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2846  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  39.89 
 
 
195 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271621  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2440  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family  39.89 
 
 
195 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3484  cytochrome c-type protein NapC  37.31 
 
 
205 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0382018  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1860  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  38.81 
 
 
220 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3359  trimethylamine-N-oxide reductase C-type cytochrome TorC  37.78 
 
 
392 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06847  cytochrome c protein, subunit of nitrate reductase  42.44 
 
 
364 aa  141  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3342  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  38.33 
 
 
392 aa  140  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.688416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0656  NapC/NirT cytochrome c-like  43.23 
 
 
389 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.57103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2425  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  38.46 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1995  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  37.71 
 
 
392 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.783137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2678  NapC/NirT family periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome  37.84 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.401671  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1233  tetraheme cytochrome c  38.29 
 
 
392 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4765  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  39.34 
 
 
195 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.719721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1052  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  38.29 
 
 
392 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.653719  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1117  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  38.29 
 
 
392 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3351  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  38.29 
 
 
392 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  38.29 
 
 
392 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1155  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  38.29 
 
 
392 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2983  periplasmic nitrate reductase subunit NapC  38.38 
 
 
198 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000569664  normal  0.0718991 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1499  periplasmic nitrate reductase c-type cytochrome, NapC/NirT  36.08 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.924736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3212  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  38.29 
 
 
392 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2551  periplasmic nitrate (or nitrite) reductase c-type cytochrome, NapC/NirT family protein  35.94 
 
 
199 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.476596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1056  trimethylamine-N-oxide reductase c-type cytochrome TorC  37.71 
 
 
392 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4367  putative cytochrome c-type protein  42.58 
 
 
160 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4219  denitrification system component NirT/cytochrome c552  41.36 
 
 
603 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.50309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1582  NapC/NirT cytochrome c, N-terminal  37.91 
 
 
195 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>