98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1667 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 
423 aa  845    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  59.34 
 
 
421 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  54.14 
 
 
420 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.82 
 
 
423 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.77 
 
 
421 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  41.21 
 
 
367 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  41.42 
 
 
371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.42 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  40.42 
 
 
371 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.37 
 
 
373 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  40.41 
 
 
373 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.63 
 
 
371 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.85 
 
 
371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.96 
 
 
373 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.83 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1941  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.09 
 
 
371 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.368246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  32.98 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.9 
 
 
360 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.75 
 
 
347 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.2 
 
 
368 aa  142  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  32.6 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.88 
 
 
345 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1485  putative transmembrane protein  34.84 
 
 
374 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3923  hypothetical protein  32.97 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.554926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  34.18 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  31.32 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.05 
 
 
351 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2440  putative transmembrane protein  33.89 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746191  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.17 
 
 
400 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  32.18 
 
 
362 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.62 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  27.58 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.03 
 
 
368 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  28.18 
 
 
366 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4145  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.41 
 
 
349 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689999  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  28.98 
 
 
363 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.99 
 
 
363 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.46 
 
 
370 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.27 
 
 
374 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  26.8 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.52 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.47 
 
 
355 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  24 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  24 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  27.13 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  26.6 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.39 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  25.13 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  25.13 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  25.13 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.2 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  25.13 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.27 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  24.61 
 
 
352 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.34 
 
 
330 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  26.26 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.68 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  23.27 
 
 
355 aa  67  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.86 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1179  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.79 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0264633 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.3 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.38 
 
 
368 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.4 
 
 
359 aa  59.7  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  33.06 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.1 
 
 
183 aa  54.3  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  32.71 
 
 
343 aa  53.9  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.08 
 
 
404 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  36.36 
 
 
349 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.93 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.65 
 
 
364 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  31.25 
 
 
103 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  34.04 
 
 
173 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.39 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1601  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.7 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382495  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2964  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.43 
 
 
407 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3786  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.41 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2861  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.85 
 
 
401 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0766776  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2308  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.36 
 
 
404 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.984289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.21 
 
 
180 aa  47  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  26.67 
 
 
237 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  27.91 
 
 
361 aa  46.6  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2823  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.53 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3607  hypothetical protein  32.5 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  28.45 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  35 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71670  hypothetical protein  31.25 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.786799  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0342  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.140154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2173  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000368304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6218  hypothetical protein  26.95 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.14 
 
 
175 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5055  YeeE/YedE  30.12 
 
 
403 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.212129  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.85 
 
 
407 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  30 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.56 
 
 
138 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  27.27 
 
 
414 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  28.89 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1691  hypothetical protein  25.16 
 
 
386 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.187562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>