175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1561 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1561  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 249 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2142  CO metabolism transcriptional regulator RcoM  48.25 
 
 		 267 aa  251  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0028  CO metabolism transcriptional regulator RcoM2  47.62 
 
 		 267 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2542  putative PAS/PAC sensor protein  33.58 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3515  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2099  sensory box protein, putative  27.5 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.374789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0056  response regulator  26.56 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1495  putative PAS/PAC sensor protein  28.22 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0619  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  33.33 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1209  putative integral membrane sensor protein  32.76 
 
 		 368 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131047  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.09 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 518 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.2 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.08 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  30.09 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.51 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2822  response regulator receiver domain-containing protein  30.7 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3804  LytTr DNA-binding region  28.83 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  30.09 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.29 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0116  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.29 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5544  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000378765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.21 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2784  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.82 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2221  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5406  ABC transporter, ATP-binding protein  27.93 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.3143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.12 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5410  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.93 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000374039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2098  putative integral membrane sensor protein  28.08 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.096975  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.91 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5461  ABC transporter, ATP-binding protein  27.93 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5134  ABC transporter ATP-binding protein, C-terminus  27.93 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4967  ABC transporter ATP-binding protein  27.93 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4985  ABC transporter, ATP-binding protein  27.93 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000703532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5376  ABC transporter, ATP-binding protein  27.93 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000218123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5083  LytTr DNA-binding region  27.93 
 
 		 335 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1149  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.68 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0503  response regulator receiver protein  36.27 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  32.99 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2062  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 489 aa  55.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  23.08 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  31.25 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.98 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  30.19 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3930  LytTR family two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.46 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11553  two-component system response regulator  27.72 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.43 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  30.65 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.06 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  29.55 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5546  response regulator, putative  27.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5512  putative response regulator  27.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5270  response regulator  27.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5097  response regulator  27.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.047582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5114  response regulator  27.1 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5667  response regulator  27.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000414392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5597  putative response regulator  27.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0176672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  25.44 
 
 		 458 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  24.81 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1965  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  33.33 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.59 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 553 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1148  response regulator receiver protein  34.04 
 
 		 295 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.573371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5541  putative response regulator  27.1 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.31 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5410  putative response regulator  27.1 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  31.31 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0504  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  29.75 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1069  two component transcriptional regulator, LytTR family  32 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  23.81 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5211  LytTR family two component transcriptional regulator  26.85 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.546332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  33.66 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  26.32 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.93 
 
 		 621 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.73 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  26.09 
 
 		 771 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0498  LytTR family two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  32.08 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2966  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>