More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1465 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  100 
 
 
400 aa  805    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  54.03 
 
 
395 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  52.94 
 
 
410 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  48.11 
 
 
396 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  47.18 
 
 
421 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  49.32 
 
 
439 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  49.73 
 
 
395 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  49.06 
 
 
377 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  47.96 
 
 
428 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  47.81 
 
 
401 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  46.43 
 
 
395 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  45.8 
 
 
409 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  47.96 
 
 
430 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  47.58 
 
 
424 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  47.85 
 
 
424 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  48.6 
 
 
417 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  47.96 
 
 
411 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  47.96 
 
 
436 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  47.68 
 
 
438 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  47.43 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  47.68 
 
 
433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  44.74 
 
 
437 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  48.4 
 
 
454 aa  348  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  45.92 
 
 
415 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  49.6 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  46.19 
 
 
445 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  44.8 
 
 
445 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  44.3 
 
 
440 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  41.28 
 
 
427 aa  323  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  45.82 
 
 
438 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  45.99 
 
 
438 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  45.95 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  45.95 
 
 
438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  44.24 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  45.27 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  46.32 
 
 
434 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  47.63 
 
 
438 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  46.77 
 
 
430 aa  316  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  47.83 
 
 
418 aa  315  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  44.54 
 
 
438 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  43.03 
 
 
448 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  46.17 
 
 
432 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  43.7 
 
 
448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  44.69 
 
 
409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  45.41 
 
 
470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  43.8 
 
 
429 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  45.05 
 
 
418 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  42.96 
 
 
422 aa  302  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  44.54 
 
 
474 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  44.69 
 
 
424 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  43.96 
 
 
413 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  44.32 
 
 
466 aa  297  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  43.96 
 
 
413 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 
398 aa  295  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  41.14 
 
 
455 aa  295  8e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  43.05 
 
 
415 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  43.72 
 
 
417 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  42.01 
 
 
398 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  42.36 
 
 
398 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 
398 aa  289  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  44.82 
 
 
417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  44.82 
 
 
419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  44.14 
 
 
390 aa  286  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  44.54 
 
 
421 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 
398 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  43.11 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3516  putative transglycosylase  41.18 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  42.13 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  41.56 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  43.58 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  41.38 
 
 
412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  41.51 
 
 
413 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  43.35 
 
 
720 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  40.51 
 
 
412 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1075  lytic murein transglycosylase  42.18 
 
 
349 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00383925  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  42.2 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 
435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  40.67 
 
 
404 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1543  putative lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 
323 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000590177  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  40 
 
 
408 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  37.27 
 
 
443 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1069  hypothetical protein  43.57 
 
 
324 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.912642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  45.33 
 
 
423 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 
405 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  40.83 
 
 
407 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  38.44 
 
 
464 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  40.72 
 
 
474 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  43.57 
 
 
429 aa  269  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  44.44 
 
 
411 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  43.26 
 
 
400 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  44.2 
 
 
392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  38.44 
 
 
451 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  38.32 
 
 
412 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01388  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  41.43 
 
 
323 aa  264  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 
461 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  38.5 
 
 
412 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.74 
 
 
462 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  42.74 
 
 
413 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  43.47 
 
 
393 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  40.05 
 
 
407 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>