More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1458 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 212 aa  234  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 376 aa  91.7  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 398 aa  89.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  30.11 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  30.2 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  26.29 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1910  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0010144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>