158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1443 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 
365 aa  733    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  58.87 
 
 
386 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  51.57 
 
 
357 aa  348  7e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  52.01 
 
 
351 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  51.93 
 
 
343 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  51.93 
 
 
343 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  54.39 
 
 
344 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  50.15 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  52.92 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  50.56 
 
 
356 aa  335  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  51.91 
 
 
344 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  49.57 
 
 
350 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  48.14 
 
 
363 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  48.43 
 
 
363 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  49.13 
 
 
340 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  52.15 
 
 
341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  50.15 
 
 
343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  47.41 
 
 
367 aa  311  9e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  46.31 
 
 
345 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  48.68 
 
 
342 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  46.31 
 
 
345 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  49.42 
 
 
355 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  46.04 
 
 
376 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  46.96 
 
 
341 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  46.8 
 
 
345 aa  295  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  47.56 
 
 
328 aa  279  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  37.57 
 
 
331 aa  256  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  44.16 
 
 
348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.69 
 
 
322 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  37.76 
 
 
330 aa  249  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.52 
 
 
348 aa  249  5e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  38.97 
 
 
349 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  44.57 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  41.09 
 
 
624 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  41.91 
 
 
350 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  38.62 
 
 
639 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  39.43 
 
 
346 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  40.8 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  40.41 
 
 
334 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  42.49 
 
 
352 aa  235  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  39.88 
 
 
349 aa  235  9e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  42.03 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  40.97 
 
 
348 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  39.43 
 
 
631 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  34.41 
 
 
339 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  38.35 
 
 
352 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  36.99 
 
 
353 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  39.14 
 
 
346 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  40 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  38.26 
 
 
640 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.83 
 
 
325 aa  219  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  41.24 
 
 
348 aa  219  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  40.35 
 
 
347 aa  219  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  38.51 
 
 
349 aa  216  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  39.65 
 
 
351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  36 
 
 
347 aa  215  8e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  37.64 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.04 
 
 
325 aa  211  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.35 
 
 
322 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  37.35 
 
 
358 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.23 
 
 
325 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  37.57 
 
 
365 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  34.24 
 
 
368 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  32.34 
 
 
325 aa  205  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  36.96 
 
 
372 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  34.91 
 
 
323 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  33.96 
 
 
368 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  34.78 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  36.57 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  34.5 
 
 
349 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  34.05 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  34.67 
 
 
385 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  37.36 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  34.39 
 
 
387 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  35.56 
 
 
370 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  34.1 
 
 
385 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  34.78 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  34.49 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  39.94 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  33.78 
 
 
370 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  33.78 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  34.66 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  33.69 
 
 
370 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  33.89 
 
 
370 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  33.72 
 
 
385 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  34.39 
 
 
368 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.05 
 
 
368 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  33.89 
 
 
370 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  33.24 
 
 
370 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  33.89 
 
 
370 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  33.61 
 
 
370 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  35.94 
 
 
350 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  37.35 
 
 
374 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  33.88 
 
 
375 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  34.42 
 
 
371 aa  189  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  34.42 
 
 
371 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  34.42 
 
 
365 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  35.29 
 
 
354 aa  189  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  33.24 
 
 
371 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  32.79 
 
 
366 aa  188  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>