More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1220 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  39.72 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  38.81 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  38.85 
 
 		 145 aa  103  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  40.71 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  40.71 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  43.38 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  42.07 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  42.22 
 
 		 146 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  40.69 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  41.38 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  43.18 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  40.44 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  40 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  39.31 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  39.31 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  39.31 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  40 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  38.85 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  39.13 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  34.53 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.03 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  36.52 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  39.1 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  38.35 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.13 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  37.78 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.86 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  38.57 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  38.57 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  36.92 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  37.8 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  36.51 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  34.78 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  41.46 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  38.74 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.78 
 
 		 158 aa  87.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  34.97 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  35.82 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  36.96 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  40.98 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  36.57 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  34.4 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  40.17 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  40.83 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  35.43 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  35.43 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  34.81 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  36.69 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35.29 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  35.07 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0857  CBS  35.07 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.20755e-23  unclonable  0.0000000599831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  33.82 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 151 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  39.02 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  32.62 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  35.07 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0759  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0525231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  34.48 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1478  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  36.69 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.58 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  35.94 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  35.51 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  34.33 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  32.35 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2616  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  35.82 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  35.82 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  32.62 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  35.54 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>