261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1203 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  610  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  31.68 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  28.01 
 
 
307 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.01 
 
 
307 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.33 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  30.33 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  28.06 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  29.22 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.62 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.3 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.67 
 
 
296 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  29.22 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  33.09 
 
 
308 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.82 
 
 
309 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.32 
 
 
275 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0099  hypothetical protein  28 
 
 
313 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  38.25 
 
 
295 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0375  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.57 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.747955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  30.96 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  27.04 
 
 
308 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  26.63 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  29.41 
 
 
301 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  29.97 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  29.97 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  24.13 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  26.71 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0493  Mammalian cell entry related domain protein  28.98 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  normal  0.0924288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  27.69 
 
 
302 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  28.9 
 
 
312 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  27.72 
 
 
306 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  26.95 
 
 
307 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  30.16 
 
 
309 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  27.16 
 
 
322 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  28.9 
 
 
312 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2284  hypothetical protein  29.15 
 
 
309 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2899  hypothetical protein  29.15 
 
 
309 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236087  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6241  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.39 
 
 
309 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4223  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.82 
 
 
320 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2908  hypothetical protein  29.15 
 
 
309 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  28.31 
 
 
330 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0070  hypothetical protein  28.16 
 
 
313 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  26.73 
 
 
323 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.34 
 
 
321 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  28.13 
 
 
321 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1794  Mammalian cell entry related domain protein  29.19 
 
 
312 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2135  mce-related protein  29.19 
 
 
312 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0207  hypothetical protein  28 
 
 
320 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  33 
 
 
304 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  27.76 
 
 
312 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  27.33 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  29.64 
 
 
310 aa  99.4  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  29.18 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  29.18 
 
 
325 aa  99  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  27.56 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  25.93 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  26.86 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  26.5 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  29.55 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  25.21 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  29.55 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  29.9 
 
 
313 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  29.09 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  27.1 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  29.89 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  27.81 
 
 
310 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  25.51 
 
 
331 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  24.65 
 
 
360 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  26.01 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  24.65 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  25.24 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  24.92 
 
 
322 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25.54 
 
 
315 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.27 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  25.84 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  29.44 
 
 
458 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  29.01 
 
 
579 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  28.25 
 
 
312 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  29 
 
 
317 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  27.82 
 
 
360 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  26.97 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  27.52 
 
 
289 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  24.53 
 
 
315 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  28.76 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  28.43 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  24.74 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  26.56 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.32 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  24.18 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.6 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  29.37 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  32.16 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  29.02 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  27.48 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>