58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1163 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1163  cytochrome c, class II  100 
 
 
149 aa  300  6e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678207  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  54.68 
 
 
155 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  50.82 
 
 
154 aa  129  1e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2256  cytochrome c, class II  30.65 
 
 
147 aa  68.2  4e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.335708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  28 
 
 
151 aa  63.5  9e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  29.93 
 
 
153 aa  63.5  9e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  28.17 
 
 
150 aa  63.2  1e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  30 
 
 
155 aa  60.5  7e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  29.84 
 
 
149 aa  57.8  5e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  6.89857e-09  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  29.84 
 
 
149 aa  57.8  5e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.08946e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  28.47 
 
 
149 aa  57.4  7e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  27.78 
 
 
149 aa  57  9e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.23618e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  27.78 
 
 
149 aa  57  9e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.42907e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  29.84 
 
 
149 aa  57  9e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.08815e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  29.41 
 
 
149 aa  57  1e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  5.71925e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  27.78 
 
 
147 aa  56.2  1e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  31.93 
 
 
150 aa  56.2  2e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1236  cytochrome C-556  30.71 
 
 
157 aa  55.5  2e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  27.15 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.39572e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0041  cytochrome c, class II  35.42 
 
 
151 aa  55.5  3e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  27.05 
 
 
155 aa  54.7  4e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  27.08 
 
 
149 aa  53.5  8e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.45313e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  26.62 
 
 
150 aa  52.4  2e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.94758e-08 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  36.05 
 
 
159 aa  52  3e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  28 
 
 
153 aa  50.8  6e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.70281e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  27.94 
 
 
136 aa  50.4  8e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  27.71 
 
 
170 aa  50.1  9e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1106  cytochrome c, class II  28.78 
 
 
152 aa  50.1  9e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108735  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  25.33 
 
 
150 aa  50.4  9e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  27.45 
 
 
153 aa  48.9  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  23.13 
 
 
156 aa  48.5  3e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  30.6 
 
 
153 aa  48.1  4e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0972  cytochrome c prime  27.97 
 
 
146 aa  48.1  4e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  29.08 
 
 
146 aa  48.1  4e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  27.56 
 
 
151 aa  48.1  4e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  28 
 
 
159 aa  48.1  4e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  27.45 
 
 
153 aa  47.8  5e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  30.6 
 
 
153 aa  48.1  5e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  2.94803e-06 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  29.85 
 
 
151 aa  47.4  6e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  24.5 
 
 
149 aa  47.4  7e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2557  cytochrome c prime  26.45 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0408  cytochrome c, class II  32.76 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0156942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  27.2 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  25 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4496  cytochrome c prime  25.34 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  25.78 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  28.57 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1043  cytochrome c, class II  25 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  28.17 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1625  cytochrome c, class II  24.31 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  22.64 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  25.4 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0850  cytochrome c prime  31.51 
 
 
146 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.990375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  21.85 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.277441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  29.76 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4843  cytochrome c, class II  28 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250644  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  29.76 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0495  cytochrome c prime  29.58 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>