13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1055 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1055  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1462  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  94  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0573227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1418  hypothetical protein  34.29 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1002  hypothetical protein  26.79 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0683  hypothetical protein  27.45 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00218027  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2487  hypothetical protein  28.79 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0375  hypothetical protein  28.71 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2242  hypothetical protein  30.25 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.85099  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1149  hypothetical protein  28.43 
 
 
178 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000392175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2491  hypothetical protein  27.83 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1334  hypothetical protein  25.23 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.355353  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1846  hypothetical protein  31.13 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00099  hypothetical protein  26.12 
 
 
148 aa  47  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>