More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1043 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  100 
 
 
312 aa  595  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  74.49 
 
 
306 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  53.96 
 
 
288 aa  295  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  53.96 
 
 
288 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  53.96 
 
 
288 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  53.96 
 
 
288 aa  288  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  54.32 
 
 
288 aa  285  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  50.71 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  52.92 
 
 
289 aa  270  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  50.37 
 
 
281 aa  269  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  50 
 
 
294 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  50.74 
 
 
290 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  54.34 
 
 
303 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  49.24 
 
 
280 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  50 
 
 
290 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  52.21 
 
 
289 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  49.82 
 
 
280 aa  249  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  50.37 
 
 
274 aa  248  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  50.19 
 
 
285 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  46.69 
 
 
278 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  46.69 
 
 
278 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  49.63 
 
 
300 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  44.7 
 
 
277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  46.38 
 
 
282 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  44.61 
 
 
279 aa  238  9e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  47.62 
 
 
290 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  47.74 
 
 
281 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  47.62 
 
 
290 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  46.76 
 
 
291 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  48.16 
 
 
278 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  48.16 
 
 
278 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  49.23 
 
 
285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  45.69 
 
 
280 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  52.22 
 
 
289 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  45.38 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  45.38 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  45.38 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  49.26 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  49.42 
 
 
285 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  46.24 
 
 
304 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  50.19 
 
 
279 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  48.29 
 
 
275 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  48.08 
 
 
286 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  43.46 
 
 
285 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  44.66 
 
 
283 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  48.03 
 
 
278 aa  225  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  49.25 
 
 
290 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  45.29 
 
 
286 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  44.78 
 
 
287 aa  222  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  41.28 
 
 
285 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  43.11 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  48.33 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.76 
 
 
282 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.76 
 
 
282 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.76 
 
 
282 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  46.48 
 
 
297 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  44.4 
 
 
287 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  40.58 
 
 
285 aa  219  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  43.32 
 
 
294 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  43.93 
 
 
285 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  43.32 
 
 
294 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  40.29 
 
 
285 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.4 
 
 
282 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  43.32 
 
 
286 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  39.93 
 
 
285 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  43.32 
 
 
294 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  42.8 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  42.46 
 
 
296 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  46.54 
 
 
285 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  40.74 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  45.68 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  40.22 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  45.68 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  42.86 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  41.98 
 
 
291 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  40.29 
 
 
286 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  43.02 
 
 
286 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  41.29 
 
 
286 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  41.29 
 
 
286 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.77 
 
 
286 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.77 
 
 
286 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.77 
 
 
286 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.77 
 
 
286 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  38.77 
 
 
286 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  47.25 
 
 
280 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  41.63 
 
 
285 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  40.36 
 
 
277 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  48.11 
 
 
287 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  39.43 
 
 
292 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  46.13 
 
 
276 aa  205  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  42.69 
 
 
279 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  47.25 
 
 
281 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  41.63 
 
 
285 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  47.1 
 
 
276 aa  203  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  41.51 
 
 
299 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  51.11 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  41.2 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  45.13 
 
 
295 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  44.49 
 
 
282 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  45.36 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>