217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1039 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 
667 aa  1358    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  39.94 
 
 
686 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  40.15 
 
 
687 aa  435  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  38.95 
 
 
688 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  38.86 
 
 
688 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  38.31 
 
 
688 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  39.04 
 
 
688 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  38.01 
 
 
710 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  37.87 
 
 
669 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  39.59 
 
 
661 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  37.98 
 
 
726 aa  419  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  38.94 
 
 
668 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  37.61 
 
 
662 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  38.52 
 
 
668 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  38.52 
 
 
668 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  36.86 
 
 
723 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  36.76 
 
 
719 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  38.25 
 
 
709 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  38.1 
 
 
687 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  37.59 
 
 
710 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  37.59 
 
 
710 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  37.59 
 
 
710 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  36.01 
 
 
676 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  38.1 
 
 
713 aa  399  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  35.86 
 
 
676 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  37.46 
 
 
667 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  36.96 
 
 
663 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  37.05 
 
 
710 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  37.2 
 
 
749 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  37.2 
 
 
753 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  35.84 
 
 
684 aa  386  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  37.2 
 
 
749 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  37.05 
 
 
745 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  37.05 
 
 
745 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  37.05 
 
 
745 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  37.2 
 
 
745 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  36.47 
 
 
724 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  37.35 
 
 
725 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  37.35 
 
 
698 aa  379  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  34.47 
 
 
686 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  34.47 
 
 
681 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  34.31 
 
 
681 aa  372  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  34.35 
 
 
691 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  32.22 
 
 
695 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.16 
 
 
665 aa  284  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 
672 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 
697 aa  212  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
699 aa  204  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  27.8 
 
 
699 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 
668 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
702 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
702 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 
681 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
768 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 
702 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 
661 aa  124  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 
684 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
760 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 
718 aa  115  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.13 
 
 
625 aa  111  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  20.06 
 
 
673 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 
698 aa  106  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 
696 aa  104  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 
716 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 
705 aa  99  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 
713 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 
713 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 
721 aa  91.3  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 
708 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 
713 aa  87.8  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  57.75 
 
 
185 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 
713 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 
683 aa  85.5  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 
685 aa  83.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 
767 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  21.07 
 
 
750 aa  78.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  22.04 
 
 
772 aa  78.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 
702 aa  75.1  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 
714 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  22.42 
 
 
708 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 
780 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  25.15 
 
 
675 aa  72  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 
713 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 
766 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.57 
 
 
750 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 
793 aa  68.9  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 
766 aa  68.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 
713 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 
749 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  20.88 
 
 
729 aa  67  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  26.71 
 
 
685 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  21.77 
 
 
751 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  22.75 
 
 
746 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  22.75 
 
 
746 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  22.75 
 
 
746 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  22.75 
 
 
746 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  22.75 
 
 
746 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  21.2 
 
 
742 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  23.17 
 
 
746 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
741 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>