More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0992 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  100 
 
 		 162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  72.96 
 
 		 165 aa  243  9e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  61.54 
 
 		 159 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  66.9 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  64.86 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  61.44 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  61.44 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  61.44 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  61.44 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  61.44 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  61.44 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  66.9 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  60.93 
 
 		 161 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  66.21 
 
 		 164 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  66.21 
 
 		 164 aa  192  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  68.35 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  66.21 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  59.48 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  67.63 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  67.63 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  67.63 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  67.63 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  67.63 
 
 		 164 aa  190  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  64.83 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  58.02 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  66.19 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  64.83 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  64.83 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  64.83 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  64.83 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  65.49 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  63.45 
 
 		 164 aa  187  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  63.45 
 
 		 164 aa  187  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  64.34 
 
 		 174 aa  186  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  66.19 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  62.76 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  59.86 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  56.67 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  62.68 
 
 		 159 aa  180  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  56.67 
 
 		 161 aa  176  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  46.15 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  41.26 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.01 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  38.62 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  38.51 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  39.58 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  31.71 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  39.86 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  34.36 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.76 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3228  putative CheW protein  51.8 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000337303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  40.76 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  44.88 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  39.86 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  39.86 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  41.55 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  41.04 
 
 		 163 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  43.17 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  35.17 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  37.33 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  36.91 
 
 		 189 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  47.01 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  37.41 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  31.79 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.99 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  37.67 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.99 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.67 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  37.41 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.75 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  35.1 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  33.78 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  35.1 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.81 
 
 		 178 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  35.71 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  34.64 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  46.15 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  34.27 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  34.69 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.96 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  46.15 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  38.03 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  37.5 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  37.76 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  44.07 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  32.72 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  35.29 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  38.24 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.77 
 
 		 170 aa  104  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.86 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  31.03 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  33.77 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  31.61 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.61 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.61 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.61 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.61 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  43.09 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  34 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>