More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0972 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  59.63 
 
 		 300 aa  318  6e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  47.69 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  49.81 
 
 		 301 aa  221  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  38.14 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  39.78 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  36.1 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  30.55 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  36.52 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  36.17 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  35.77 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  32.3 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  35.77 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  36.17 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  36.17 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  35.56 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  35.4 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 		 302 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  34.51 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  35.61 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  34.53 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  34.69 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  38.03 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  39.32 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  32.1 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  32.75 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  37.23 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  34.1 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  25.49 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  24.17 
 
 		 339 aa  79  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  21.4 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  30.11 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.83 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  21.15 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  24.19 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.56 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  27.68 
 
 		 346 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  24.21 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  23.18 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  24.18 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  28.35 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  33.33 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  33.33 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  26.78 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.77 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.77 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  26.98 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  25.31 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  27.83 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  29.92 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1968  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  25.18 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  29.55 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  28.76 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  30.43 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  23.92 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.15 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  25.66 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  21.1 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  24.81 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  21.79 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  22.44 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  27.2 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.87 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  28.44 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  26.03 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  31.25 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  30.68 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  23.51 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  30.68 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  29.63 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  20.89 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  28.68 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  21.3 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  24.8 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>