46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0916 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  244  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  39.53 
 
 
464 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2223  hypothetical protein  34.62 
 
 
214 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  36.9 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.37 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  32.31 
 
 
453 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  30.49 
 
 
126 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  40.68 
 
 
149 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1115  hypothetical protein  35.94 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  35.42 
 
 
425 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  41.1 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  37.36 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  37.08 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  39.29 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_002936  DET1333  hypothetical protein  31.08 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  46.55 
 
 
471 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  39.24 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_751  hypothetical protein  38.1 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0185287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  37.23 
 
 
438 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  42.86 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  40.91 
 
 
430 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  41.79 
 
 
464 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  35.82 
 
 
458 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  40.98 
 
 
490 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  33.66 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1571  protein of unknown function DUF107  33.96 
 
 
159 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.704744  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0847  hypothetical protein  38.1 
 
 
96 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000202964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2369  nodulation efficiency protein NfeD  46.55 
 
 
472 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  33.96 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  34.43 
 
 
473 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0766  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  38.1 
 
 
96 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.328817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  32.08 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1590  protein of unknown function DUF107  44.83 
 
 
471 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0501  hypothetical protein  38.57 
 
 
152 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  41.67 
 
 
150 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  33.04 
 
 
144 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  41.79 
 
 
464 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  33.68 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  27.27 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  35.56 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  38.71 
 
 
463 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  42.86 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  41.67 
 
 
488 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  39.32 
 
 
437 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  32.39 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  46.81 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>