More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0883 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0883  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
363 aa  697  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 
380 aa  140  4e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 
354 aa  135  2e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  29 
 
 
354 aa  132  7e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 
354 aa  131  1e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 
363 aa  130  4e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  28.91 
 
 
354 aa  130  5e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 
359 aa  130  5e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 
374 aa  129  5e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 
354 aa  129  8e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 
426 aa  128  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 
357 aa  126  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.71 
 
 
349 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 
406 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.55 
 
 
388 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 
358 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  27.55 
 
 
406 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 
358 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.28 
 
 
368 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 
354 aa  122  1e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 
354 aa  121  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  28.76 
 
 
365 aa  121  2e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 
354 aa  121  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.78 
 
 
376 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  28.02 
 
 
354 aa  120  4e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 
354 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 
350 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  26.9 
 
 
368 aa  117  4e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.55433e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 
383 aa  116  7e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  26.67 
 
 
361 aa  115  8e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  29.3 
 
 
390 aa  115  9e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.03 
 
 
380 aa  115  1e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 
366 aa  114  2e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  26.63 
 
 
352 aa  114  2e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  25.07 
 
 
367 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  30.61 
 
 
353 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  30.03 
 
 
381 aa  114  4e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  28.92 
 
 
370 aa  112  1e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  26.74 
 
 
379 aa  112  1e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  27.59 
 
 
366 aa  112  1e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  3.31728e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 
364 aa  111  2e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 
379 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 
377 aa  110  4e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  26.01 
 
 
373 aa  110  4e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 
390 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  28.53 
 
 
366 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6178  RND family efflux transporter MFP subunit  31.25 
 
 
367 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  25.47 
 
 
368 aa  109  8e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.47 
 
 
405 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.41 
 
 
349 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  31.42 
 
 
360 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 
343 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  24.58 
 
 
368 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 
409 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  2.85815e-06  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 
397 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.42 
 
 
416 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.3 
 
 
421 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 
389 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.3 
 
 
421 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 
358 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 
374 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  32.45 
 
 
389 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  27.55 
 
 
376 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  29.4 
 
 
382 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.5375e-08  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.15 
 
 
372 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.55 
 
 
375 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  28.37 
 
 
383 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 
360 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.42821e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  28.63 
 
 
421 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 
340 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 
382 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  24.14 
 
 
372 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  25.42 
 
 
416 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.24755e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.72 
 
 
409 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
397 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  24.23 
 
 
353 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.64 
 
 
413 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  28.83 
 
 
385 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  27.81 
 
 
384 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 
398 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.07 
 
 
430 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
381 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  28.61 
 
 
386 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 
393 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 
399 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 
415 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  26.24 
 
 
390 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  21.94 
 
 
364 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.49187e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  29.43 
 
 
376 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 
390 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 
410 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 
365 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  8.83837e-08 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 
430 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  27.21 
 
 
360 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  7.07575e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 
401 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.38 
 
 
392 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  30.74 
 
 
367 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  25.28 
 
 
372 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  23.75 
 
 
372 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.21 
 
 
360 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.36323e-06  hitchhiker  1.1193e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>