More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0865 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  45.66 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  38.76 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  38.28 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  38.28 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  40.78 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  40.78 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  37.8 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  40.78 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 211 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  37.75 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  38.38 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  46.43 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  37.71 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  40.79 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  32.67 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  39.11 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  32.31 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  37.3 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  35.39 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  31.79 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  39.55 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  34.43 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  38.79 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  34.52 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.04 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  34.86 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  33.99 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  37.86 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  34.44 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  38.57 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  40.69 
 
 		 212 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  36.52 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  36.72 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  34.46 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  35.23 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 239 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.82 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0582  electron transport protein SCO1/SenC  36.32 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.658799  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  31.09 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  31.49 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  31.07 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  30.35 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  29.76 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  34.81 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  31.98 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  34.34 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
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NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  32.95 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
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NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.71 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  32.51 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  32.41 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  33.73 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  32.96 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  32.49 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0823  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108097  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  32.32 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  32.26 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  32.26 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  32.95 
 
 		 291 aa  102  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  32.26 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  32.26 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  32.26 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  32.26 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  34.64 
 
 		 196 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  31.66 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  36.24 
 
 		 287 aa  101  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  31.72 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  32.34 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  31.61 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  32.7 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  31.65 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  32.1 
 
 		 246 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  34.88 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
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NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  29.87 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  29.87 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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