88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0795 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 
379 aa  772    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  98.42 
 
 
379 aa  764    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  37.73 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  36.05 
 
 
435 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  35.88 
 
 
425 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  34.9 
 
 
403 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  35.75 
 
 
398 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  36.45 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  36.64 
 
 
430 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  33.25 
 
 
421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  39.49 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  34.46 
 
 
393 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  33 
 
 
421 aa  215  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  35.6 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  35.01 
 
 
416 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  36.11 
 
 
387 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  35.44 
 
 
421 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  35.28 
 
 
428 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  36.11 
 
 
398 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  33.25 
 
 
408 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  35.18 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  32.35 
 
 
431 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  34.51 
 
 
420 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  32.35 
 
 
417 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  34.94 
 
 
471 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  32.26 
 
 
417 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  36.05 
 
 
380 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  32.84 
 
 
406 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  34.81 
 
 
407 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  34.49 
 
 
416 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  33.77 
 
 
419 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  32.53 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  32.64 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  36.57 
 
 
424 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  32.76 
 
 
417 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  35.11 
 
 
418 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  35 
 
 
388 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  35.86 
 
 
382 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  31.75 
 
 
384 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  31.91 
 
 
420 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  29.4 
 
 
399 aa  161  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  28.17 
 
 
369 aa  160  4e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  30.79 
 
 
401 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.76 
 
 
403 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  31.61 
 
 
401 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  31.22 
 
 
382 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  31.22 
 
 
382 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  33 
 
 
424 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  31.88 
 
 
401 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  26.4 
 
 
382 aa  145  1e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  28.22 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  28.2 
 
 
390 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  24.43 
 
 
383 aa  136  5e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  32.89 
 
 
400 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  31.56 
 
 
399 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  29.32 
 
 
385 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  29.32 
 
 
385 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  30.03 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.03 
 
 
397 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  29.9 
 
 
385 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  29.63 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  27.33 
 
 
385 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.42 
 
 
405 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  26.85 
 
 
386 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  28.78 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  28.97 
 
 
386 aa  94  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.65 
 
 
562 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  23.99 
 
 
514 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  24.31 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  25.6 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  26.63 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  22.74 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  22.74 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  26.64 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  23.67 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  24.27 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  24.27 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  24.27 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  22.57 
 
 
394 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  28.95 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  24.88 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  25.47 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  23.97 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  26.95 
 
 
440 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  24.23 
 
 
425 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  26.63 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  22.16 
 
 
391 aa  46.6  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  22.55 
 
 
337 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>