46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0677 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  294  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  46.72 
 
 
143 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  43.97 
 
 
144 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  43.94 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  38.35 
 
 
149 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  36.84 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  40.74 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  38.41 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  36.36 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  34.01 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  31.21 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  38.1 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2124  hypothetical protein  35.11 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  34.23 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2211  hypothetical protein  33.83 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197087  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  35.71 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  32.84 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  32.59 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  31.51 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  30.4 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  31.39 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  41.11 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  34.81 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  42.39 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  34.71 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  39.58 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  25.68 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  29.58 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  32.81 
 
 
118 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  30.16 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0693  hypothetical protein  30.08 
 
 
134 aa  47  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  31.63 
 
 
132 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  29.25 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02108  hypothetical protein  31.19 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  29.29 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  30.95 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3881  hypothetical protein  27.27 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  0.573766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  26.43 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  25.44 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  26.42 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5065  Host attachment protein  27.34 
 
 
166 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.839567  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  24.81 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  25.55 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>