23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0649 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0649  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  531  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0510982  normal  0.051482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2150  hypothetical protein  41.98 
 
 
265 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  29.36 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43090  hypothetical protein  36.94 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  3.20878e-16  normal  0.206346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69540  hypothetical protein  32.82 
 
 
293 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149099  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3453  hypothetical protein  42.62 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2187  hypothetical protein  40.58 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1213  hypothetical protein  26.52 
 
 
308 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  37.18 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0042  hypothetical protein  31.96 
 
 
299 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1807  hypothetical protein  23.81 
 
 
421 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319152  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1743  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  46.2  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2613  hypothetical protein  26.01 
 
 
316 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.528993  normal  0.0499502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4489  hypothetical protein  29.79 
 
 
288 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447001  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5437  hypothetical protein  31.3 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21460  hypothetical protein  29.17 
 
 
271 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2116  hypothetical protein  25.99 
 
 
307 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2043  hypothetical protein  29.73 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0455  hypothetical protein  35.71 
 
 
226 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.864871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2578  hypothetical protein  25.86 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0235149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2571  hypothetical protein  25.86 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0247949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2564  hypothetical protein  25.86 
 
 
261 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00349718  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5072  hypothetical protein  44.44 
 
 
167 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.106886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>