13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0647 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0646  hypothetical protein  94.25 
 
 
377 aa  664  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436257  normal  0.112784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0647  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  797  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  normal  0.0829547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69510  hypothetical protein  33.05 
 
 
357 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133748  normal  0.588689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3852  hypothetical protein  27.54 
 
 
306 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3853  hypothetical protein  26.96 
 
 
299 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0040  hypothetical protein  32.56 
 
 
443 aa  56.2  9e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2251  hypothetical protein  24.12 
 
 
317 aa  55.1  2e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0843  hypothetical protein  29.17 
 
 
444 aa  54.3  4e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2758  hypothetical protein  26.48 
 
 
308 aa  51.2  3e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0207  hypothetical protein  21.66 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.610772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02057  hypothetical protein  23.6 
 
 
247 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.09997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7606  hypothetical protein  23.01 
 
 
360 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3919  hypothetical protein  26.47 
 
 
262 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.961515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>