88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0644 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  98.42 
 
 		 379 aa  764    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 379 aa  772    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  38.52 
 
 		 388 aa  246  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  36.27 
 
 		 435 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  35.42 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  36.27 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  35.52 
 
 		 425 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  37.05 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  36.81 
 
 		 421 aa  222  9e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  37.19 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  35.06 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  39.17 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  39.72 
 
 		 421 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  36.13 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  36.02 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  36.5 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  36.26 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  36.73 
 
 		 398 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  34.83 
 
 		 450 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  36.73 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  34.02 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  33.17 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  35.6 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  35.26 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  35.44 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  36.99 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  34.76 
 
 		 471 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  32.85 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  33.33 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  34.66 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  37.54 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  34.04 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  33.74 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  37.05 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  32.18 
 
 		 389 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  37.79 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  35.33 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  36.18 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  31.75 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  30.03 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  32.19 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  28.42 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  31.27 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  31.27 
 
 		 401 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  31.54 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  31.22 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  31.22 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  32.68 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.72 
 
 		 403 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  26.4 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  29.56 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  24.18 
 
 		 383 aa  135  8e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  28.2 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  33.22 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  31.56 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  30.36 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  29.32 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  29.32 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.36 
 
 		 397 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  29.9 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  29.63 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.78 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  27.85 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  27.24 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  29.14 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  28.97 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  22.73 
 
 		 562 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  25.93 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  23.65 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  22.74 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  26.64 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  22.74 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  25.26 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  26.36 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  23.67 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  24.6 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  24.6 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  24.6 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  21.94 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  24.88 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  28.95 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  25.47 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.07 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  26.95 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  24.68 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  22.68 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  26.63 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  22.88 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>