More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0637 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  100 
 
 
411 aa  835    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  50.82 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  52.83 
 
 
410 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  51.25 
 
 
398 aa  383  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  47.22 
 
 
406 aa  362  8e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  48.84 
 
 
411 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  44.61 
 
 
403 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  46.53 
 
 
438 aa  339  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  43.49 
 
 
419 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  46.55 
 
 
400 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  47.56 
 
 
397 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  44.9 
 
 
410 aa  329  6e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  44.88 
 
 
436 aa  322  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  44.56 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  44.27 
 
 
459 aa  319  6e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  46.17 
 
 
409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  44.58 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  46.35 
 
 
408 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  43.8 
 
 
415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  45.07 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  42.18 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  47.59 
 
 
397 aa  302  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  43.87 
 
 
401 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  43.78 
 
 
407 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  43.04 
 
 
399 aa  295  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  45.04 
 
 
420 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  41.49 
 
 
429 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  47.49 
 
 
391 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  41.01 
 
 
429 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  44.69 
 
 
420 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  44.27 
 
 
412 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  43.95 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  40.66 
 
 
411 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  43.82 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  39.76 
 
 
417 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  44.3 
 
 
407 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  40.35 
 
 
403 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  38.32 
 
 
434 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  43.94 
 
 
365 aa  262  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  43.94 
 
 
359 aa  262  8e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  40.1 
 
 
402 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  40.31 
 
 
400 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  45.49 
 
 
279 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  36.47 
 
 
450 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  48.43 
 
 
228 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  32.82 
 
 
384 aa  186  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  33.74 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  36.8 
 
 
402 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  33.02 
 
 
421 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  31.6 
 
 
410 aa  176  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  32.8 
 
 
387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  34.22 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  32.4 
 
 
411 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.86 
 
 
402 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  33.51 
 
 
391 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  30.85 
 
 
409 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  31.22 
 
 
396 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.03 
 
 
420 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  33.67 
 
 
438 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  31.94 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  34.13 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  31.68 
 
 
404 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  32.38 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  31.46 
 
 
387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  34.2 
 
 
404 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  35.28 
 
 
397 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  33.16 
 
 
396 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  33.08 
 
 
401 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  32.09 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.69 
 
 
391 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  31.68 
 
 
404 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 
404 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  31.82 
 
 
404 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  31.25 
 
 
417 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  31.15 
 
 
394 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  31.15 
 
 
394 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.63 
 
 
394 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.89 
 
 
394 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  30.59 
 
 
412 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  29.66 
 
 
408 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  31.47 
 
 
410 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  33.75 
 
 
413 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  30.94 
 
 
408 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  32.22 
 
 
414 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  30 
 
 
418 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  30.43 
 
 
389 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  31.81 
 
 
397 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  33.16 
 
 
406 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  32.72 
 
 
378 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  34.69 
 
 
425 aa  157  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  31.32 
 
 
406 aa  156  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  30.62 
 
 
415 aa  155  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  30.67 
 
 
396 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  34.11 
 
 
401 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  30.26 
 
 
409 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  30.98 
 
 
423 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  29.6 
 
 
404 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  31.54 
 
 
413 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  31.14 
 
 
416 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  31.2 
 
 
416 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>