211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0594 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0594  porin  100 
 
 		 354 aa  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  56.21 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  47.18 
 
 		 368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  30.73 
 
 		 365 aa  133  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  30.54 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  29.75 
 
 		 342 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  25.66 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  27.75 
 
 		 339 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  35.23 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  27.6 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  27.57 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  25.35 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  29.29 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  26.5 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  25.26 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  26.37 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  28 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  24.36 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  24.36 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  24.04 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  32.12 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  27.5 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  26.33 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  24.48 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  27.04 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  31.82 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  25.81 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  27.52 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  27.52 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  23.4 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  26.95 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  29.02 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  27.81 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  25.65 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  25.71 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  25.71 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  27.44 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  28.87 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  25.71 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  25.96 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  25.28 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  26.71 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  25.89 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  25.13 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  29.73 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  25.78 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  25.08 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  26.63 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  25.32 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  26.01 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  24.52 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  28.47 
 
 		 361 aa  53.1  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  24.4 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  30.57 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  24.24 
 
 		 383 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  25.94 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  24.42 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  26.4 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  26.26 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  25.94 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  25.71 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  27.98 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  24.8 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  31.3 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  27.61 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  24.85 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  26.56 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  26.88 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  27.66 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  24.63 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  24.71 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  24.63 
 
 		 356 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  22.34 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  26.48 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  30.94 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0024  porin Gram-negative type  30.13 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.133917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  26.59 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  23.67 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  24.17 
 
 		 345 aa  50.8  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  24.82 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  26.43 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  24.57 
 
 		 357 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  24.77 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  22.69 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  22.69 
 
 		 350 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  26.72 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  27.67 
 
 		 353 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  24.64 
 
 		 358 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  25.51 
 
 		 387 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  30.41 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3484  porin  24.71 
 
 		 357 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  24.86 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  24.86 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  24.29 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  27.23 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  23.93 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  25 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  29.52 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  26.11 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  26.11 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>