49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0590 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0590  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040025  unclonable  1.11393e-18 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0609  type IV pilus assembly PilZ  51.24 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2982  hypothetical protein  40.5 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.438088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3079  type IV pilus assembly PilZ  40.5 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3180  type IV pilus assembly PilZ  40.83 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0971521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  38.98 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  36.75 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4639  hypothetical protein  36.89 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0982  hypothetical protein  37.19 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  35.59 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0757  type IV pilus assembly PilZ  35.54 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4884  hypothetical protein  37.29 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1149  type IV pilus assembly PilZ  34.51 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.189898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3218  type IV pilus assembly PilZ  34.51 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3357  type IV pilus assembly PilZ  34.51 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91457  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2945  type IV pilus assembly PilZ  41.27 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454411  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3218  type IV pilus assembly PilZ  34.51 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4049  hypothetical protein  37.5 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4274  hypothetical protein  39.34 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043847  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  32.48 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3535  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3368  type IV pilus assembly PilZ  34.19 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.967691  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3884  hypothetical protein  36.13 
 
 
120 aa  70.1  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1227  hypothetical protein  32.54 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  35.04 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2813  type IV pilus assembly PilZ  34.51 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0796  type IV pilus assembly PilZ  39.34 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3156  type IV pilus assembly PilZ  36.97 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254909  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1111  type IV pilus assembly PilZ  30.09 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1046  type IV pilus assembly PilZ  30.09 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.314079  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60970  hypothetical protein  35.51 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1417  hypothetical protein  33.91 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5248  hypothetical protein  35.51 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  30.17 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  32.77 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  30.17 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2133  hypothetical protein  34.71 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4642  type IV pilus assembly PilZ  38.02 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.769649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4636  type IV pilus assembly PilZ  37.4 
 
 
121 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124678  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4504  type IV pilus assembly PilZ  37.19 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.833775  normal  0.872973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1036  type IV pilus assembly PilZ  32.79 
 
 
125 aa  60.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  31.45 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2110  type IV pilus assembly PilZ  35.09 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.623877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1289  type IV pilus assembly PilZ  30.47 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3031  type IV pilus assembly PilZ  32.82 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  30.7 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  26.02 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  33.64 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  30.09 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>