More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0588 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0588  alanine racemase  100 
 
 		 365 aa  728    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0886157  hitchhiker  9.74231e-17 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0652  alanine racemase  56.98 
 
 		 364 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6076  alanine racemase  53.11 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5269  alanine racemase  50 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  50 
 
 		 357 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69990  alanine racemase  51.98 
 
 		 357 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5179  alanine racemase  49.72 
 
 		 357 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.266317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0237  alanine racemase  50.56 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0201  alanine racemase  50.72 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5524  alanine racemase  49.01 
 
 		 365 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0247  alanine racemase  50.42 
 
 		 362 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47960  alanine racemase  51.99 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0103  alanine racemase, catabolic  49.15 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0928  alanine racemase  54.55 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2388  alanine racemase  49.14 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0932  alanine racemase, biosynthetic  44.89 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1082  alanine racemase  44.89 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00790418  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  47.46 
 
 		 356 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  45.69 
 
 		 358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  47.73 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  47.73 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  47.73 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  47.73 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  47.73 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  47.73 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  47.73 
 
 		 359 aa  318  9e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  49 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0224  alanine racemase region  50.28 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  47.44 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4605  alanine racemase  47.44 
 
 		 359 aa  316  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  48.71 
 
 		 358 aa  315  8e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  48.56 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  48.56 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4495  alanine racemase  47.74 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.182607  normal  0.0659463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4589  alanine racemase  47.74 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4590  alanine racemase  47.74 
 
 		 359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.718448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  48.56 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4641  alanine racemase  47.74 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.291614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  47.99 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  44.79 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4504  alanine racemase  47.74 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  44.73 
 
 		 375 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  48.28 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  45.1 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  44.51 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  45.33 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  46.02 
 
 		 359 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1004  alanine racemase  48.15 
 
 		 378 aa  309  4e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  47.7 
 
 		 358 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2100  alanine racemase  48.88 
 
 		 367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  46.55 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2362  alanine racemase  44.92 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.166545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  45.89 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3580  alanine racemase  45.98 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000398757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  47.41 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0445  alanine racemase  47.84 
 
 		 355 aa  305  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  47.41 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1959  alanine racemase  45.48 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1335  alanine racemase  45.48 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000853808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3995  alanine racemase  48.99 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1677  alanine racemase  45.48 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000165096  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3499  alanine racemase  45.66 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3637  alanine racemase  46.31 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  46.84 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2000  alanine racemase  44.92 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01165  alanine racemase  45.2 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2435  alanine racemase  45.2 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0660359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01175  hypothetical protein  45.2 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0067944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1293  alanine racemase  45.2 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000195233  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0939  alanine racemase  42.05 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0708  alanine racemase  45.38 
 
 		 358 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2458  alanine racemase  44.92 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000612069  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1940  alanine racemase  44.79 
 
 		 356 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1331  alanine racemase  44.79 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221405  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0754  alanine racemase  45.01 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000492133  normal  0.112637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  44.73 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1516  alanine racemase  44.51 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0732192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3345  alanine racemase  43.61 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2629  alanine racemase  46.63 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.962151  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3854  alanine racemase  44.73 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00269497  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1944  alanine racemase  44.51 
 
 		 356 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0640294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3764  alanine racemase  44.73 
 
 		 359 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000118138  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1999  alanine racemase  45.95 
 
 		 369 aa  295  8e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.711487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  46.09 
 
 		 357 aa  295  8e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1923  alanine racemase  45.95 
 
 		 362 aa  295  9e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03074  alanine racemase  46.91 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1715  alanine racemase  47.18 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5657  biosynthetic alanine racemase  45.2 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65110  biosynthetic alanine racemase  45.2 
 
 		 358 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0650  alanine racemase  43.82 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000416834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3976  alanine racemase  46.39 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.087726  normal  0.384892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1734  alanine racemase  48.28 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0740  alanine racemase  45.01 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3490  alanine racemase  45.96 
 
 		 373 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.541285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4504  alanine racemase  45.28 
 
 		 373 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.142172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0961  alanine racemase  45.66 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1965  alanine racemase  44.72 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1047  alanine racemase  45.66 
 
 		 374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2286  alanine racemase  45.66 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1940  alanine racemase  44.76 
 
 		 356 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466995  normal  0.712057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>