258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0560 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
360 aa  698    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  56.08 
 
 
350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  38.55 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  42.06 
 
 
353 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  39.28 
 
 
357 aa  242  7e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  35.34 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  40.17 
 
 
355 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  40.17 
 
 
355 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  37.5 
 
 
353 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  40.06 
 
 
354 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  35.77 
 
 
353 aa  225  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  33.82 
 
 
354 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  39.2 
 
 
353 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  34.56 
 
 
353 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  38.24 
 
 
356 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  32.29 
 
 
356 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  37.26 
 
 
358 aa  215  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  38.02 
 
 
353 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  33.61 
 
 
352 aa  215  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  35.83 
 
 
356 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  33.24 
 
 
351 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  34.17 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  35.71 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  33.14 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  34.46 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  36.65 
 
 
353 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 
353 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 
353 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  32.77 
 
 
352 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  35.62 
 
 
358 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  35.62 
 
 
358 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  35.62 
 
 
358 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  33.52 
 
 
352 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  35.8 
 
 
353 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  36.03 
 
 
356 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  37.53 
 
 
358 aa  209  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  33.72 
 
 
352 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  33.43 
 
 
352 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  35.81 
 
 
356 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  34.59 
 
 
356 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  33.71 
 
 
353 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  33.43 
 
 
352 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  32.39 
 
 
352 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  33.05 
 
 
356 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  29.33 
 
 
356 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  33.14 
 
 
352 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  29.61 
 
 
356 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  32.28 
 
 
352 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  32.28 
 
 
352 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  32.28 
 
 
352 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  32.28 
 
 
352 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  34.84 
 
 
352 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  39.53 
 
 
353 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  31.99 
 
 
352 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  32.63 
 
 
370 aa  199  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  34.48 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  31.93 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  34.48 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  34.48 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  34.48 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  34.48 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  34.48 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  34.77 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  34.77 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  34.77 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  34.77 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  34.77 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  34.77 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  34.77 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  34.77 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  34.77 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  35.01 
 
 
354 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  34.07 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  35.24 
 
 
358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  33.24 
 
 
368 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  34.17 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  32.28 
 
 
353 aa  173  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 
354 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  29.38 
 
 
383 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  31.55 
 
 
359 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  26.03 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  26.3 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  33.43 
 
 
356 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  30.99 
 
 
359 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  31.07 
 
 
359 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 
386 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  31.27 
 
 
359 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  31.27 
 
 
359 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  27.59 
 
 
387 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  32.49 
 
 
368 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  31.88 
 
 
354 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0100  permease YjgP/YjgQ family protein  32.21 
 
 
368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  24.62 
 
 
401 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0116  hypothetical protein  31.67 
 
 
368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0947899  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 
382 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  26.05 
 
 
382 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  29.11 
 
 
373 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 
397 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 
397 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  32.48 
 
 
356 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>