259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0559 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
372 aa  724    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  53.85 
 
 
372 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  41.81 
 
 
367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  42.02 
 
 
373 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  40.05 
 
 
372 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  40.88 
 
 
381 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  39.78 
 
 
375 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  42.32 
 
 
371 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  39.78 
 
 
375 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  42.32 
 
 
383 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  42.41 
 
 
371 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  38.51 
 
 
367 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  41.83 
 
 
371 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  42.44 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  39.25 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  40 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  42.15 
 
 
372 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  36.83 
 
 
371 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  36.73 
 
 
370 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  36.81 
 
 
366 aa  218  8.999999999999998e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.98 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  32.3 
 
 
359 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  36.18 
 
 
370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  32.3 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  35.71 
 
 
369 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  36.65 
 
 
370 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 
370 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  36.65 
 
 
370 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  37.32 
 
 
370 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  34.94 
 
 
370 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  36.16 
 
 
368 aa  207  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  36.23 
 
 
370 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  34.32 
 
 
361 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  36.54 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  36.47 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  36.18 
 
 
370 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  36.18 
 
 
370 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  32.69 
 
 
388 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  32.57 
 
 
370 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  31.44 
 
 
366 aa  195  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  31.87 
 
 
366 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  36.06 
 
 
370 aa  192  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  33.15 
 
 
372 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  35.33 
 
 
370 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  32.38 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  34.26 
 
 
372 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  33.62 
 
 
371 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  32.87 
 
 
372 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  31.52 
 
 
365 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  31.52 
 
 
365 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  31.52 
 
 
365 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  31.52 
 
 
365 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  31.52 
 
 
365 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  31.52 
 
 
365 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  31.52 
 
 
365 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  37.36 
 
 
386 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  32.66 
 
 
370 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02661  putative permease, YjgP/YjgQ family  38.92 
 
 
360 aa  183  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  31.29 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  32.06 
 
 
366 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  30.95 
 
 
363 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  34.66 
 
 
339 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  30.99 
 
 
364 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  32.56 
 
 
358 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  31.6 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  31.6 
 
 
364 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  31.6 
 
 
364 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  31.04 
 
 
367 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  32.16 
 
 
365 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  31.87 
 
 
365 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  30.98 
 
 
363 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0537  permease YjgP/YjgQ family protein  38.63 
 
 
360 aa  175  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613487  normal  0.97553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  32.87 
 
 
370 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  28.89 
 
 
371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  33.24 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  32.04 
 
 
371 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  30.2 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  28.29 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  29.91 
 
 
358 aa  159  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  32.34 
 
 
369 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  32.22 
 
 
364 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  32.22 
 
 
364 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  32.22 
 
 
364 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  29.46 
 
 
360 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  29.17 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  32.19 
 
 
371 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  31.95 
 
 
357 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  33.23 
 
 
359 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  27.73 
 
 
373 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  34.62 
 
 
366 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  32.53 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  31.39 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  33.24 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  33.24 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  33.24 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  33.24 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  33.24 
 
 
366 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  33.24 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0875  hypothetical membrane spanning protein  31.83 
 
 
372 aa  139  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  33.24 
 
 
366 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>