45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0503 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
362 aa  730    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  63.66 
 
 
356 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  60.91 
 
 
360 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  60.45 
 
 
362 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  57.63 
 
 
355 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  42.54 
 
 
345 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  41.29 
 
 
349 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  41.74 
 
 
351 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  42.29 
 
 
346 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  45.45 
 
 
354 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  41.81 
 
 
351 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  46.28 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  40.34 
 
 
353 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  43.35 
 
 
357 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  40.52 
 
 
331 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  41.21 
 
 
352 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  39.4 
 
 
397 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  35.87 
 
 
353 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  34.94 
 
 
341 aa  173  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  50.34 
 
 
150 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  40.71 
 
 
242 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  31.01 
 
 
393 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  33.75 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1810  Appr-1-p processing enzyme  32.16 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.175893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  32.33 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  29.22 
 
 
158 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  28.75 
 
 
168 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  28.75 
 
 
168 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  29.55 
 
 
146 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  26.38 
 
 
165 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  26.19 
 
 
190 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  29.85 
 
 
152 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  31.86 
 
 
147 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3357  Appr-1-p processing domain protein  31.85 
 
 
162 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4194  appr-1-p processing domain-containing protein  27.03 
 
 
181 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311672  hitchhiker  0.00223052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0336  Appr-1-p processing domain protein  27.88 
 
 
177 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42632e-27 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  25.4 
 
 
152 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  26.06 
 
 
161 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0355  Appr-1-p processing domain protein  27.61 
 
 
177 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0730899  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  25.66 
 
 
167 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3571  Appr-1-p processing domain protein  29.1 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  27.17 
 
 
179 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0308  appr-1-p processing domain-containing protein  26.11 
 
 
173 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0428  phage-associated protein-like protein  35.71 
 
 
178 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0358952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>