295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0490 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
463 aa  955    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  65.95 
 
 
476 aa  618  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  53.78 
 
 
478 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  54.73 
 
 
478 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  54.28 
 
 
480 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  54.28 
 
 
480 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.81 
 
 
480 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  49.36 
 
 
462 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.81 
 
 
480 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.81 
 
 
480 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  52.93 
 
 
480 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  50.32 
 
 
465 aa  476  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  52.9 
 
 
484 aa  475  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  53.02 
 
 
481 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.58 
 
 
464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  49.15 
 
 
465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  48.07 
 
 
464 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.66 
 
 
490 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51.56 
 
 
490 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  50.34 
 
 
478 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  50.11 
 
 
489 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  47.76 
 
 
462 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.48 
 
 
541 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  48.17 
 
 
467 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  48.93 
 
 
468 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  47 
 
 
467 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  47 
 
 
467 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.92 
 
 
455 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  46.98 
 
 
470 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.74 
 
 
466 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  45.79 
 
 
535 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.53 
 
 
466 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  45.79 
 
 
469 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.31 
 
 
543 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.2 
 
 
530 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  42.76 
 
 
525 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.42 
 
 
536 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  46.9 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  44.01 
 
 
547 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  42.89 
 
 
522 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.95 
 
 
467 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  44.64 
 
 
515 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.94 
 
 
540 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  45.81 
 
 
464 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  45.88 
 
 
524 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.7 
 
 
525 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  45.01 
 
 
531 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  40.86 
 
 
536 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  42.37 
 
 
544 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  43.32 
 
 
465 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  41.63 
 
 
570 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  40 
 
 
464 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.68 
 
 
470 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  41.51 
 
 
535 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 
536 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.46 
 
 
474 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  43.01 
 
 
462 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  43.01 
 
 
462 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  40.77 
 
 
536 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  40.69 
 
 
465 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.78 
 
 
469 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  39.83 
 
 
467 aa  359  5e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  39.19 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.7 
 
 
471 aa  354  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.55 
 
 
465 aa  350  4e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  38.43 
 
 
464 aa  348  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  39.14 
 
 
451 aa  342  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  38.62 
 
 
468 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  39.57 
 
 
468 aa  334  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  40.52 
 
 
455 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  41.38 
 
 
452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  38.48 
 
 
469 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  41.94 
 
 
461 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
453 aa  319  5e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  39.32 
 
 
455 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1441  beta-lactamase-like  41.94 
 
 
540 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.168792  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  41.88 
 
 
460 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.69 
 
 
460 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  38.12 
 
 
476 aa  316  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  40.22 
 
 
472 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 
460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 
452 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  37.72 
 
 
452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 
454 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4627  beta-lactamase domain protein  41.94 
 
 
542 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  38.66 
 
 
461 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  38.41 
 
 
453 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.51 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  37.39 
 
 
452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  35.55 
 
 
467 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1898  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.31 
 
 
532 aa  307  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  39.48 
 
 
468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 
455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1185  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 
447 aa  305  8.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000645588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 
455 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  39.14 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  36.64 
 
 
452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 
454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>