More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0433 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 
575 aa  1127    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  46.93 
 
 
591 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  45.72 
 
 
575 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  43.46 
 
 
585 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  41.25 
 
 
585 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  35.81 
 
 
604 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  31.83 
 
 
559 aa  276  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  38.13 
 
 
575 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.41 
 
 
574 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  37.83 
 
 
574 aa  250  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0983  chloride channel core  39.53 
 
 
573 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.76 
 
 
582 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  35.53 
 
 
579 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  34.35 
 
 
574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.31 
 
 
614 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1121  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.26 
 
 
574 aa  229  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  33.05 
 
 
613 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1093  Cl-channel, voltage-gated family protein  39.57 
 
 
569 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00228292  decreased coverage  0.00554461 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1302  chloride channel  38.66 
 
 
574 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  36.2 
 
 
615 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1239  chloride channel core  38.61 
 
 
574 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1206  chloride channel core  38.12 
 
 
574 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1161  chloride channel core  38.12 
 
 
574 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.541504  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3151  Chloride channel core  38.12 
 
 
574 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1015  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.53 
 
 
569 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.411818  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2973  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.88 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000658505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3069  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.88 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.724246  hitchhiker  0.00000035598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2891  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.88 
 
 
574 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0598145  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01599  putative Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA  32.61 
 
 
538 aa  213  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  35.92 
 
 
600 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  33.94 
 
 
587 aa  209  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  33.26 
 
 
608 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  37.11 
 
 
626 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0841  chloride channel  38.25 
 
 
571 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.690246 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.29 
 
 
584 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.79 
 
 
597 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  32.82 
 
 
569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.03 
 
 
591 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.36 
 
 
606 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.31 
 
 
577 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.09 
 
 
627 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.11 
 
 
591 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.62 
 
 
579 aa  178  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.62 
 
 
579 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.93 
 
 
629 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.62 
 
 
579 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.62 
 
 
636 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.83 
 
 
591 aa  177  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  33.5 
 
 
669 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.37 
 
 
620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  27.21 
 
 
602 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  31.43 
 
 
470 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.32 
 
 
628 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.83 
 
 
598 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  33.72 
 
 
589 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  31.29 
 
 
456 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  29.8 
 
 
613 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.53 
 
 
577 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.79 
 
 
593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.79 
 
 
593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0845  Chloride channel core  29.41 
 
 
640 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0525209 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  29.84 
 
 
562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.27 
 
 
624 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  29.6 
 
 
543 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.58 
 
 
589 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.58 
 
 
589 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  32.62 
 
 
461 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  33.17 
 
 
464 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  33.17 
 
 
464 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.58 
 
 
589 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  25.42 
 
 
631 aa  160  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  27.55 
 
 
628 aa  159  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.31 
 
 
565 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.46 
 
 
580 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.75 
 
 
897 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  35.79 
 
 
527 aa  158  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  31.63 
 
 
590 aa  157  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0693  Cl- channel, voltage gated  27.17 
 
 
564 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0559233  hitchhiker  0.000374815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  32.99 
 
 
633 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  26.77 
 
 
627 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  30.14 
 
 
593 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  28.26 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  25.67 
 
 
598 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.14 
 
 
754 aa  143  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2413  chloride channel core  33.16 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  28.85 
 
 
533 aa  140  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1421  Cl- channel, voltage gated  29.77 
 
 
586 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.86 
 
 
526 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  29.71 
 
 
586 aa  139  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  26.87 
 
 
879 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  26.87 
 
 
879 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0516  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  31.74 
 
 
601 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.7 
 
 
612 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  34.38 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  26.88 
 
 
603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  26.48 
 
 
595 aa  133  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  31.51 
 
 
468 aa  133  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  31.64 
 
 
605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.67 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.67 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>