More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0376 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  66.2 
 
 		 220 aa  260  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  60.09 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  60.09 
 
 		 221 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  60.09 
 
 		 221 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  60.09 
 
 		 221 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  59.63 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  59.91 
 
 		 220 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  58.99 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  57.08 
 
 		 227 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  58.53 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  58.06 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 220 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  57.6 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  59.28 
 
 		 216 aa  234  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  58.53 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  53.18 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  62.37 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  52.7 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  55.05 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  51.36 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  54.13 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  56.02 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  56.02 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  52.94 
 
 		 221 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  54.13 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  53.67 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  53.67 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  53.21 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  60.82 
 
 		 199 aa  215  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  59.59 
 
 		 201 aa  214  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  52.51 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  56 
 
 		 200 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  51.58 
 
 		 221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  48.39 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  56.94 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  54 
 
 		 208 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  51.36 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  56.04 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  57.14 
 
 		 197 aa  205  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  56.1 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  55.61 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  50.91 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  54.31 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  54.31 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  55.67 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  54.42 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  54.63 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  54.63 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  52.86 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  56.7 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  54.63 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  51.85 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  53.17 
 
 		 211 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  53.59 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  53.59 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  52.45 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  54.41 
 
 		 204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  45.74 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  51.23 
 
 		 202 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  51.02 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 200 aa  184  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  52.71 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  47.22 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  44.35 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  47.66 
 
 		 216 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  54 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  54.95 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  52.63 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  54.11 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.01 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  51.49 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  43.26 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  44.2 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  51.26 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>