More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0353 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
350 aa  690  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  45.75 
 
 
347 aa  262  7e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0936  ApbE family lipoprotein  43.17 
 
 
349 aa  245  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0317624  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2402  ApbE family lipoprotein  44.63 
 
 
350 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  39.56 
 
 
362 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  41.08 
 
 
344 aa  220  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  36.9 
 
 
346 aa  214  1e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3187  positive regulator of sigma E, RseC/MucC  44.05 
 
 
365 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.981913 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3926  ApbE family lipoprotein  44.19 
 
 
366 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166642  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  33.65 
 
 
351 aa  199  4e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3188  ApbE family protein  44.52 
 
 
524 aa  196  4e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  39.03 
 
 
370 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  39.03 
 
 
352 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  39.03 
 
 
352 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  37.64 
 
 
352 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  40.73 
 
 
291 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  33.92 
 
 
353 aa  165  1e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 
348 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  30.84 
 
 
348 aa  159  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.49 
 
 
363 aa  156  5e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.71 
 
 
331 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  32.41 
 
 
380 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52679e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  36.25 
 
 
351 aa  152  6e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0511  ApbE family lipoprotein  26.93 
 
 
360 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  29.82 
 
 
360 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.46 
 
 
345 aa  149  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  33.23 
 
 
336 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  36.23 
 
 
386 aa  142  1e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  25.69 
 
 
366 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  37 
 
 
310 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  32.62 
 
 
336 aa  137  3e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.17 
 
 
381 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  26.98 
 
 
350 aa  136  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  30.55 
 
 
333 aa  134  2e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  29.38 
 
 
339 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  1.41849e-06 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.95 
 
 
369 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  36.63 
 
 
335 aa  132  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  33.04 
 
 
340 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  30.07 
 
 
339 aa  132  1e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.31 
 
 
349 aa  132  1e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.23 
 
 
371 aa  132  1e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30 
 
 
349 aa  130  4e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  32.08 
 
 
379 aa  130  4e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.73 
 
 
343 aa  129  5e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.63 
 
 
355 aa  130  5e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  40 
 
 
339 aa  128  1e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  31.27 
 
 
341 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  30.55 
 
 
353 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  30.45 
 
 
346 aa  127  4e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  37.65 
 
 
362 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.93 
 
 
297 aa  126  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.43 
 
 
337 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  35.51 
 
 
308 aa  125  8e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.84 
 
 
336 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.75 
 
 
306 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.66 
 
 
367 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  31.73 
 
 
345 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  28.98 
 
 
343 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  31.9 
 
 
336 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.77 
 
 
342 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  31.16 
 
 
335 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  34.94 
 
 
337 aa  121  1e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.91 
 
 
341 aa  122  1e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  30.3 
 
 
338 aa  121  2e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  29.75 
 
 
338 aa  121  2e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  30.21 
 
 
336 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.91 
 
 
370 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.51305e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.42 
 
 
349 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 
317 aa  120  4e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  35.04 
 
 
322 aa  120  4e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  32.9 
 
 
340 aa  120  4e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  32.31 
 
 
331 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  28.47 
 
 
330 aa  119  8e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.45 
 
 
349 aa  118  1e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  27.18 
 
 
323 aa  118  2e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 
321 aa  117  2e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  27.21 
 
 
328 aa  118  2e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  34.3 
 
 
327 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  32 
 
 
368 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  31.19 
 
 
344 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  31.86 
 
 
323 aa  117  4e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  28.02 
 
 
347 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  27.43 
 
 
338 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  32 
 
 
365 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 
348 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 
320 aa  116  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 
348 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 
348 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 
348 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.16 
 
 
309 aa  116  7e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  26.74 
 
 
352 aa  115  8e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  36.09 
 
 
345 aa  115  9e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  33.6 
 
 
343 aa  115  1e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30 
 
 
344 aa  115  1e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  30.82 
 
 
350 aa  115  1e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.81 
 
 
338 aa  115  1e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  32.46 
 
 
326 aa  115  1e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  35.68 
 
 
362 aa  114  2e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  35.02 
 
 
327 aa  114  2e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  29.07 
 
 
337 aa  114  2e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>