244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0261 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03841  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.55 
 
 		 883 aa  835    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4030  Phosphoenolpyruvate carboxylase  49.55 
 
 		 883 aa  835    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1505  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.51 
 
 		 875 aa  852    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27976  predicted protein  44.9 
 
 		 1009 aa  719    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.1 
 
 		 881 aa  827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1508  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.84 
 
 		 878 aa  872    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4217  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.51 
 
 		 875 aa  853    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638207  normal  0.736372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3928  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.31 
 
 		 879 aa  839    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1318  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.91 
 
 		 878 aa  872    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0969534  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4783  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.49 
 
 		 878 aa  848    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.380349  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00045  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.65 
 
 		 888 aa  828    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4442  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.55 
 
 		 883 aa  835    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39300  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.03 
 
 		 878 aa  870    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4190  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.55 
 
 		 883 aa  835    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4524  phosphoenolpyruvate carboxylase  50 
 
 		 883 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.77 
 
 		 876 aa  845    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0757254 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4450  phosphoenolpyruvate carboxylase  50 
 
 		 883 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0357723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4091  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.34 
 
 		 878 aa  840    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3900  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.34 
 
 		 898 aa  842    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4112  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.83 
 
 		 875 aa  846    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.08 
 
 		 879 aa  851    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2754  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.7 
 
 		 876 aa  825    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.98 
 
 		 878 aa  827    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4403  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.55 
 
 		 883 aa  835    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494951 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3380  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.92 
 
 		 873 aa  748    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000188284  normal  0.443016 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00742  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.14 
 
 		 873 aa  774    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00719358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.78 
 
 		 887 aa  834    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1640  phosphoenolpyruvate carboxylase  52.02 
 
 		 883 aa  816    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00188681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0225  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.38 
 
 		 878 aa  805    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5416  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.55 
 
 		 883 aa  835    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4060  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.55 
 
 		 883 aa  835    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0606  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.39 
 
 		 872 aa  767    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00195008  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4495  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.55 
 
 		 883 aa  835    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305581  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0994  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.16 
 
 		 879 aa  799    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4329  phosphoenolpyruvate carboxylase  50 
 
 		 883 aa  849    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.04 
 
 		 889 aa  824    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0235  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.04 
 
 		 889 aa  827    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.859727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 882 aa  1776    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0189  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.26 
 
 		 882 aa  815    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000683526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  54.61 
 
 		 878 aa  880    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0125  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.34 
 
 		 878 aa  840    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3906  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.04 
 
 		 889 aa  826    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.04 
 
 		 878 aa  804    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.83 
 
 		 876 aa  851    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.27 
 
 		 889 aa  832    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.45 
 
 		 887 aa  822    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.41 
 
 		 878 aa  822    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03790  hypothetical protein  49.55 
 
 		 883 aa  835    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2234  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.19 
 
 		 881 aa  842    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0190  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.51 
 
 		 880 aa  850    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1110  phosphoenolpyruvate carboxylase  53.85 
 
 		 875 aa  857    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4360  phosphoenolpyruvate carboxylase  50 
 
 		 912 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  71.02 
 
 		 883 aa  1242    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002310  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.53 
 
 		 877 aa  822    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.16 
 
 		 889 aa  829    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  55 
 
 		 878 aa  884    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.04 
 
 		 889 aa  829    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0200  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.34 
 
 		 878 aa  816    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.611049  normal  0.122744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.27 
 
 		 889 aa  832    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51006  predicted protein  42.38 
 
 		 1007 aa  678    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  normal  0.0264006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4447  phosphoenolpyruvate carboxylase  50 
 
 		 883 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4030  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.22 
 
 		 883 aa  850    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.366538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  49.27 
 
 		 889 aa  828    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  55.97 
 
 		 878 aa  900    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4350  phosphoenolpyruvate carboxylase  51.08 
 
 		 879 aa  850    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2222  phosphoenolpyruvate carboxylase  48.93 
 
 		 887 aa  826    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000647926  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_51136  predicted protein  43.24 
 
 		 877 aa  632  1e-180  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.68 
 
 		 906 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.96 
 
 		 928 aa  545  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.45 
 
 		 920 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.89 
 
 		 929 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  41 
 
 		 926 aa  529  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.11 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.01 
 
 		 954 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.33 
 
 		 937 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.51 
 
 		 933 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.46 
 
 		 929 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.05 
 
 		 945 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.96 
 
 		 931 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.78 
 
 		 933 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.26 
 
 		 936 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.8 
 
 		 933 aa  508  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0729  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.09 
 
 		 994 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.37 
 
 		 918 aa  505  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1228  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.09 
 
 		 1085 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.774396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.49 
 
 		 1008 aa  506  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.76 
 
 		 937 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.92 
 
 		 994 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  39.54 
 
 		 929 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.32 
 
 		 1009 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2286  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.09 
 
 		 994 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2999  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.09 
 
 		 994 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1069  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.09 
 
 		 994 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1075  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.09 
 
 		 1024 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1599  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.09 
 
 		 994 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.737727  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.32 
 
 		 994 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.18 
 
 		 946 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.41 
 
 		 998 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  40.38 
 
 		 1004 aa  502  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.18 
 
 		 946 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>