More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0246 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  65.12 
 
 
759 aa  1018    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  65.25 
 
 
759 aa  1020    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  49.47 
 
 
752 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  64.99 
 
 
759 aa  1021    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  45.03 
 
 
759 aa  649    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  58.94 
 
 
757 aa  895    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  62.72 
 
 
756 aa  976    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2123  malic enzyme  63.73 
 
 
773 aa  969    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.223978  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2767  malic enzyme  64.49 
 
 
781 aa  958    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0582903  normal  0.182467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1010  malic enzyme  61.47 
 
 
765 aa  911    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0551739 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  75.69 
 
 
764 aa  1212    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  62.72 
 
 
756 aa  976    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3439  malic enzyme  64.8 
 
 
771 aa  972    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  56.89 
 
 
759 aa  878    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1017  malic enzyme  62.58 
 
 
774 aa  933    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1256  malic enzyme  64.93 
 
 
769 aa  973    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  45.48 
 
 
763 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4071  malic enzyme  62.15 
 
 
776 aa  914    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4759  malic enzyme  60.56 
 
 
770 aa  907    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1095  malic enzyme  62.72 
 
 
766 aa  928    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1646  malic enzyme  62.73 
 
 
774 aa  913    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186396  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2477  malic enzyme  64.93 
 
 
769 aa  973    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.622597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  62.72 
 
 
756 aa  976    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  62.72 
 
 
756 aa  976    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0396  malic enzyme  64.93 
 
 
769 aa  973    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  48.32 
 
 
749 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  60.4 
 
 
779 aa  949    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0666  malic enzyme  63.89 
 
 
759 aa  951    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121288  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  62.38 
 
 
758 aa  981    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  64.06 
 
 
777 aa  997    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2847  malic enzyme  63.43 
 
 
774 aa  923    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  46.66 
 
 
763 aa  659    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  62.72 
 
 
756 aa  976    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1587  malic enzyme  60.19 
 
 
760 aa  881    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  62.72 
 
 
773 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3474  malic enzyme  64.8 
 
 
769 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0622  malic enzyme  61.04 
 
 
777 aa  914    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0117628  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  45.14 
 
 
783 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  48.66 
 
 
752 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  59.55 
 
 
779 aa  967    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1593  malic enzyme  57.98 
 
 
759 aa  873    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  62.72 
 
 
756 aa  975    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3713  malic enzyme  64.68 
 
 
785 aa  975    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302892  normal  0.094119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2662  malic enzyme  60.13 
 
 
782 aa  894    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  49.87 
 
 
752 aa  754    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  62.72 
 
 
756 aa  976    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0807  malic enzyme  60.13 
 
 
768 aa  886    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1112  malic enzyme  60.65 
 
 
769 aa  903    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0984  malic enzyme  62.72 
 
 
774 aa  934    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  65.25 
 
 
759 aa  1020    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1189  malic enzyme  64.6 
 
 
768 aa  974    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  62.32 
 
 
756 aa  973    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  48.61 
 
 
771 aa  685    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2497  malic enzyme  59.31 
 
 
769 aa  843    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1277  malic enzyme  64.69 
 
 
759 aa  1001    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3876  malic enzyme  61.97 
 
 
769 aa  952    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0175  malic enzyme  46.27 
 
 
758 aa  655    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2100  malic enzyme  62.58 
 
 
774 aa  915    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.921998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2989  malic enzyme  55.45 
 
 
758 aa  822    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210734  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0093  malic enzyme  62.32 
 
 
769 aa  956    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.351367  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1424  malic enzyme  61.84 
 
 
771 aa  939    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2337  malic enzyme  59.44 
 
 
769 aa  864    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1421  malic enzyme  62.15 
 
 
767 aa  943    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4858  malic enzyme  62.68 
 
 
772 aa  931    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633507  normal  0.0500953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  62.2 
 
 
760 aa  982    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0557  malic enzyme  63.78 
 
 
779 aa  973    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3355  malic enzyme  64 
 
 
772 aa  977    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0207  malic enzyme  62.83 
 
 
764 aa  920    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.850785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2946  malic enzyme  59.52 
 
 
769 aa  852    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.542462  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0224  malic enzyme  62.37 
 
 
773 aa  954    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2110  malic enzyme  60.19 
 
 
765 aa  889    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  60.4 
 
 
777 aa  946    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0878  malic enzyme  63.47 
 
 
773 aa  991    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716606  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3046  malic enzyme  64.1 
 
 
774 aa  922    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.472837  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  55.41 
 
 
759 aa  844    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  46.32 
 
 
754 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2792  malic enzyme  47.79 
 
 
754 aa  657    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.776027  normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0148  malic enzyme  64.64 
 
 
785 aa  976    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  62.32 
 
 
756 aa  967    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  62.72 
 
 
756 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1536  malic enzyme  63.26 
 
 
770 aa  929    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  47.06 
 
 
773 aa  659    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  49.33 
 
 
757 aa  706    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0465  malic enzyme  59.76 
 
 
755 aa  915    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00312155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0246  malic enzyme  58.11 
 
 
759 aa  873    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3143  malic enzyme  61.97 
 
 
760 aa  905    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.231587  normal  0.133413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  100 
 
 
776 aa  1582    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3309  malic enzyme  64.93 
 
 
769 aa  973    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1904  malic enzyme  57.05 
 
 
755 aa  816    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.894987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1558  malic enzyme  61.49 
 
 
770 aa  915    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0734911  normal  0.266658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  62.87 
 
 
756 aa  972    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0532  malic enzyme  64.15 
 
 
766 aa  971    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4462  malic enzyme  61.33 
 
 
766 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668544  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0274  malic enzyme  57.71 
 
 
759 aa  871    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  62.32 
 
 
756 aa  967    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0631  malic enzyme  64.64 
 
 
785 aa  976    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3496  malic enzyme  60.27 
 
 
766 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  49.4 
 
 
757 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3476  malic enzyme  64.8 
 
 
769 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4106  malic enzyme  62.55 
 
 
770 aa  931    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>