184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0240 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  43.57 
 
 		 252 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  39.11 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  31.73 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  31.73 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  30.11 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  33.06 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  35.66 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  33.82 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  30.89 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  30.92 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  27.62 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  27.62 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  29.06 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  33.81 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.61 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  28.02 
 
 		 322 aa  99  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  28.44 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1427  hypothetical protein  30.25 
 
 		 254 aa  95.9  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  26.09 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  29.05 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  32.74 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  30.36 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  25.51 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  30.36 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  29.96 
 
 		 262 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  29.96 
 
 		 262 aa  89  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  31.65 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 251 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  28.2 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  28.2 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  28.2 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  28.2 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  28.2 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  28.2 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  28.2 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  28.2 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2673  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  27.02 
 
 		 263 aa  86.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  30.62 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  29.61 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  28.2 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0797  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  28.96 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1627  transmembrane protein  26.75 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0686  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379534  normal  0.398306 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1371  hypothetical protein  25.66 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0730  tol-pal system protein YbgF  28.38 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18828  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2083  hypothetical protein  25.22 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3258  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0825  hypothetical protein  25.22 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2659  hypothetical protein  25.22 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3205  tol-pal system protein YbgF  25.22 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3243  tol-pal system protein YbgF  25.22 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1951  tol-pal system protein YbgF  25.22 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  27.67 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  27.67 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  28.67 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  29.61 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01613  hypothetical protein  27.73 
 
 		 188 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  29.1 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0692  tol-pal system protein YbgF  23.05 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000467208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0737  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.790435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  28.05 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3887  hypothetical protein  23.87 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  26.15 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0675  hypothetical protein  23.05 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0840445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  27.98 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  27.64 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0767  tol-pal system protein YbgF  23.46 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0348274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0315  hypothetical protein  23.46 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00113686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0798  hypothetical protein  23.46 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00161054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  27.98 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  25.49 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  32 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  23.87 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2589  tol-pal system protein YbgF  23.87 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  23.46 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  26.75 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  25.94 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2527  hypothetical protein  28.5 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000191168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  22.63 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  27.8 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  31.9 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  32.04 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>