More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0193 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  855    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  61.58 
 
 
420 aa  518  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  58.4 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  56.83 
 
 
435 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  56.79 
 
 
422 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 
417 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  54.46 
 
 
417 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  54.2 
 
 
436 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  56.55 
 
 
426 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  56.55 
 
 
426 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  55.69 
 
 
426 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  54.39 
 
 
418 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  55.17 
 
 
420 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  53.96 
 
 
440 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  55.23 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  58.67 
 
 
439 aa  464  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  55.28 
 
 
438 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  55.28 
 
 
438 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  56.31 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  56.31 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  56.31 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  56.31 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  57.07 
 
 
409 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  56.57 
 
 
427 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  55.53 
 
 
437 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  56.37 
 
 
429 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  51.95 
 
 
431 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  51.95 
 
 
431 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  47.74 
 
 
418 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  49.26 
 
 
409 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  48.01 
 
 
421 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  48.01 
 
 
421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  45.52 
 
 
912 aa  345  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  47.15 
 
 
422 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  44.44 
 
 
895 aa  343  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  47.01 
 
 
424 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  47.26 
 
 
424 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  47.01 
 
 
424 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  47.01 
 
 
424 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 
428 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  45.3 
 
 
905 aa  329  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  41.47 
 
 
441 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  45.41 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  45.66 
 
 
426 aa  312  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 
443 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  44.87 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  38.55 
 
 
424 aa  299  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  38.66 
 
 
424 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  37.26 
 
 
431 aa  296  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  44.8 
 
 
917 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  40.82 
 
 
402 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  42.96 
 
 
893 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
444 aa  286  7e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  43.54 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  44.34 
 
 
460 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  43.86 
 
 
459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 
413 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  43.75 
 
 
424 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  40.54 
 
 
422 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  37.86 
 
 
472 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  40.1 
 
 
472 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  28.99 
 
 
389 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  39.02 
 
 
494 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  28.74 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  28.74 
 
 
389 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  28.74 
 
 
389 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  28.74 
 
 
389 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  28.74 
 
 
389 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  28.5 
 
 
389 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  28.74 
 
 
389 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  28.5 
 
 
389 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  29.76 
 
 
389 aa  193  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  41.97 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 
506 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  33.43 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  31.54 
 
 
423 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
382 aa  180  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  31.91 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  30.71 
 
 
404 aa  173  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  29.74 
 
 
403 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  30.27 
 
 
403 aa  163  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  30.71 
 
 
411 aa  163  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
404 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  30.49 
 
 
403 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  25.89 
 
 
389 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  25.89 
 
 
389 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
395 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  29.59 
 
 
403 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
406 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3087  major facilitator superfamily transporter  28.17 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
398 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  29.46 
 
 
403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  29.4 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  26.12 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  29.38 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  26.19 
 
 
418 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
397 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>