More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0175 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  100 
 
 
324 aa  648    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  47.68 
 
 
285 aa  245  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  44.21 
 
 
323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  44.7 
 
 
290 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
352 aa  229  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  37.93 
 
 
297 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  38.8 
 
 
311 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  42.59 
 
 
265 aa  198  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  43.51 
 
 
260 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  36.79 
 
 
278 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  36.26 
 
 
332 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  56.44 
 
 
265 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  35.33 
 
 
261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  35.33 
 
 
265 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  33.64 
 
 
280 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  34.06 
 
 
277 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  33.33 
 
 
280 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  32 
 
 
281 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  33.33 
 
 
280 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  38.25 
 
 
341 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  33.75 
 
 
277 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  33.75 
 
 
277 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  34.38 
 
 
277 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  43.31 
 
 
295 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  37.5 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  34.75 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  36.28 
 
 
333 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  36.76 
 
 
284 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  35.97 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  49.11 
 
 
264 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  40.42 
 
 
335 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  35.96 
 
 
333 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  36.47 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  61.31 
 
 
257 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  35.96 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  35.05 
 
 
293 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  36.18 
 
 
342 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  38.17 
 
 
342 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  58.45 
 
 
273 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  43.17 
 
 
331 aa  176  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  57.75 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  34.84 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  55.78 
 
 
415 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  32.57 
 
 
322 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  55.78 
 
 
417 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.48 
 
 
286 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  43.36 
 
 
381 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  35.88 
 
 
267 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.51 
 
 
267 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  40.65 
 
 
333 aa  168  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  36.98 
 
 
263 aa  168  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  43.08 
 
 
322 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  37.14 
 
 
394 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  47.9 
 
 
269 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  49.44 
 
 
260 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  36.33 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  45.37 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  34.07 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  39 
 
 
325 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  37.74 
 
 
310 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  54.66 
 
 
391 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  50.34 
 
 
423 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  59.35 
 
 
258 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  56.12 
 
 
254 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  63.06 
 
 
249 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  34.67 
 
 
409 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  54.33 
 
 
243 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  34.69 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  45.56 
 
 
270 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  44.92 
 
 
230 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  37.04 
 
 
259 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  36.4 
 
 
238 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  36.59 
 
 
339 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  36.8 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
264 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  55.86 
 
 
275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  55.86 
 
 
266 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  55.86 
 
 
275 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  59.65 
 
 
259 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  38.46 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  58.56 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  37.46 
 
 
303 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1818  rare lipoprotein A, putative  34.38 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1495  rare lipoprotein A  34.38 
 
 
274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.16 
 
 
408 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  56.76 
 
 
318 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  42.77 
 
 
240 aa  132  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  56.14 
 
 
160 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  56.14 
 
 
160 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  41.01 
 
 
455 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  41.05 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  38.94 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  49.23 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  41.01 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  52.31 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  47.33 
 
 
442 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  40.87 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  40.45 
 
 
468 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  39.81 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>