More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0156 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 955 aa  1865    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  38.23 
 
 		 935 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 934 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 873 aa  361  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.84 
 
 		 929 aa  263  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 931 aa  239  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.32 
 
 		 924 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 944 aa  209  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 927 aa  207  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 952 aa  180  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  25.05 
 
 		 924 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 923 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  25.25 
 
 		 933 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 900 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  22.57 
 
 		 924 aa  125  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.18 
 
 		 729 aa  124  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  26.97 
 
 		 931 aa  124  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  23.29 
 
 		 937 aa  120  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 917 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  21.49 
 
 		 892 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.79 
 
 		 884 aa  118  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  22.13 
 
 		 918 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  22.71 
 
 		 917 aa  114  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  24.5 
 
 		 864 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.2 
 
 		 1979 aa  102  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.57 
 
 		 572 aa  102  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 729 aa  101  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  20.58 
 
 		 924 aa  100  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  23.28 
 
 		 940 aa  99.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 		 572 aa  99  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 		 1694 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 878 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1069 aa  94  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 927 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 884 aa  93.2  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1676 aa  92.8  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 		 883 aa  92.8  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 886 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 591 aa  92.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3385  tetratricopeptide  26.77 
 
 		 811 aa  91.3  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  31.19 
 
 		 475 aa  91.7  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 860 aa  89.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.3 
 
 		 2240 aa  89.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 886 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.37 
 
 		 786 aa  89.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  20.15 
 
 		 1297 aa  89  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  21.8 
 
 		 914 aa  88.6  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.46 
 
 		 573 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 4079 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.8 
 
 		 1154 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.56 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.62 
 
 		 1737 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  27.77 
 
 		 584 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.24 
 
 		 810 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 750 aa  83.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 767 aa  82  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 2262 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 2262 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 573 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.44 
 
 		 887 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.95 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.56 
 
 		 725 aa  80.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  21.23 
 
 		 2059 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1276 aa  79  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.21 
 
 		 1486 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.87 
 
 		 3172 aa  78.2  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.6 
 
 		 882 aa  78.2  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.9 
 
 		 732 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 		 512 aa  77  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 827 aa  77.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 3145 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 847 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  19.69 
 
 		 1056 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  23.21 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 562 aa  73.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 543 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.01 
 
 		 566 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.88 
 
 		 882 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 586 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.18 
 
 		 733 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 800 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.69 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.85 
 
 		 2401 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  20.16 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 486 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 		 632 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  23.94 
 
 		 1077 aa  71.6  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.3 
 
 		 1067 aa  71.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  23.02 
 
 		 1073 aa  71.2  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.45 
 
 		 883 aa  71.2  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.49 
 
 		 638 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 468 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.95 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 880 aa  68.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>