201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0096 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
559 aa  1115  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.74 
 
 
560 aa  408  1e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  39.71 
 
 
563 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  39.39 
 
 
598 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.51 
 
 
565 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.86 
 
 
547 aa  354  3e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  36 
 
 
563 aa  339  7e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.99 
 
 
560 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.75 
 
 
566 aa  322  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.82 
 
 
549 aa  320  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  40.45 
 
 
546 aa  319  8e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  8.90514e-05 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  35.56 
 
 
563 aa  316  8e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.21 
 
 
556 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.83 
 
 
549 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  32 
 
 
571 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.08 
 
 
560 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.87 
 
 
560 aa  290  5e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 
549 aa  286  6e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1632  hypothetical protein  38.48 
 
 
564 aa  282  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  34.26 
 
 
536 aa  282  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.86 
 
 
560 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.15 
 
 
540 aa  276  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  36.46 
 
 
546 aa  276  1e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.46 
 
 
546 aa  276  1e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  36.4 
 
 
554 aa  275  2e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.74 
 
 
399 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  8.18135e-05 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.48 
 
 
535 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.93 
 
 
544 aa  270  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  30.77 
 
 
558 aa  269  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  36.82 
 
 
563 aa  264  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  29.15 
 
 
568 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.01 
 
 
625 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  34.43 
 
 
557 aa  262  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  36.78 
 
 
576 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  36.43 
 
 
575 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  35.05 
 
 
540 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003127  L,D-transpeptidase YcbB  39.36 
 
 
513 aa  256  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00544147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2145  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.19 
 
 
531 aa  254  2e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535243  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1501  peptidoglycan binding domain-containing protein  39 
 
 
498 aa  255  2e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
458 aa  254  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0887  hypothetical protein  39.05 
 
 
524 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 
775 aa  254  4e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.8 
 
 
540 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  32.29 
 
 
811 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02710  hypothetical protein  40.57 
 
 
530 aa  252  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  36.07 
 
 
606 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.27 
 
 
724 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.91 
 
 
599 aa  250  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.67 
 
 
629 aa  250  6e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  35.01 
 
 
616 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  35.32 
 
 
615 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.5 
 
 
543 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  1.15115e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  35.32 
 
 
615 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  33.73 
 
 
607 aa  249  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  37.79 
 
 
419 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  35.32 
 
 
615 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  36.54 
 
 
410 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  36.4 
 
 
530 aa  247  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  33.33 
 
 
618 aa  247  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  33.33 
 
 
618 aa  247  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  34.99 
 
 
611 aa  247  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.98 
 
 
716 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  33.33 
 
 
596 aa  247  5e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  32.39 
 
 
661 aa  246  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  40.26 
 
 
613 aa  246  7e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  34.75 
 
 
615 aa  246  7e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.97 
 
 
472 aa  246  7e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185448  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1327  hypothetical protein  37.5 
 
 
512 aa  246  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.592833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  34.75 
 
 
615 aa  245  1e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  34.75 
 
 
615 aa  245  2e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.54 
 
 
443 aa  245  2e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  34.75 
 
 
615 aa  245  2e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  34.75 
 
 
615 aa  245  2e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  34.75 
 
 
615 aa  245  2e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.75 
 
 
615 aa  244  2e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  34.75 
 
 
615 aa  245  2e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.39 
 
 
506 aa  244  3e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.92 
 
 
624 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.16 
 
 
516 aa  244  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.97379e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  31.87 
 
 
718 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.39 
 
 
526 aa  243  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  35.36 
 
 
410 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 
461 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179987  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  33.33 
 
 
537 aa  239  7e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2451  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.75 
 
 
465 aa  239  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000544854  normal  0.511504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.19 
 
 
500 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.08 
 
 
525 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.4 
 
 
672 aa  237  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1957  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.59 
 
 
451 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.732042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.05 
 
 
473 aa  236  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1898  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.3 
 
 
521 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.79 
 
 
539 aa  236  1e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  30.28 
 
 
523 aa  235  1e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.05 
 
 
521 aa  234  2e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1892  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.84 
 
 
484 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.36 
 
 
540 aa  234  4e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.82 
 
 
433 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.12 
 
 
670 aa  233  7e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.95 
 
 
730 aa  233  7e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  32.02 
 
 
561 aa  233  8e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>