255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0091 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  100 
 
 
471 aa  922  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 
430 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  40.2 
 
 
427 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  42.67 
 
 
415 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  38.53 
 
 
452 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  39.77 
 
 
473 aa  266  6e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  38.22 
 
 
444 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  39.38 
 
 
465 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  37.9 
 
 
447 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  38.31 
 
 
444 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  9.83336e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  38.36 
 
 
446 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  37.73 
 
 
443 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 
436 aa  254  2e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  39.9 
 
 
446 aa  252  8e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  38.5 
 
 
434 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  38.54 
 
 
409 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  38.26 
 
 
434 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  38.52 
 
 
447 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  36.59 
 
 
412 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  37.77 
 
 
412 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  40.71 
 
 
436 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
417 aa  246  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  38.12 
 
 
412 aa  244  2e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  35.25 
 
 
411 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  37.29 
 
 
412 aa  240  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  36.11 
 
 
726 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  39.08 
 
 
444 aa  233  8e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  39.07 
 
 
443 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  34.16 
 
 
397 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  33.11 
 
 
474 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  3.37729e-07  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  33.62 
 
 
520 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  30.88 
 
 
428 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  35.19 
 
 
417 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  31.78 
 
 
459 aa  223  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  40.3 
 
 
429 aa  222  1e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  38.25 
 
 
427 aa  222  1e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  34.65 
 
 
713 aa  220  4e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  32.65 
 
 
480 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  32.65 
 
 
480 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.1219e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  36.17 
 
 
418 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  36.17 
 
 
418 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
480 aa  219  8e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.05807e-08  hitchhiker  1.80087e-08 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  36.41 
 
 
433 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  31.99 
 
 
474 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  32.64 
 
 
476 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.74953e-05  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  32.64 
 
 
476 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.95189e-08  hitchhiker  1.89305e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  30.64 
 
 
474 aa  217  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  32.43 
 
 
480 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  6.34429e-07  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  32.93 
 
 
481 aa  215  2e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  33.5 
 
 
418 aa  214  4e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  33.5 
 
 
418 aa  213  6e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  34.33 
 
 
429 aa  213  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 
432 aa  213  8e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
432 aa  213  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  32.59 
 
 
464 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  34.9 
 
 
418 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  35.81 
 
 
429 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  31.77 
 
 
446 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  31.77 
 
 
446 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  31.78 
 
 
429 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  31.77 
 
 
446 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  37.79 
 
 
438 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  34.88 
 
 
416 aa  206  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  36.85 
 
 
438 aa  202  1e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  39.9 
 
 
412 aa  202  1e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  34.1 
 
 
433 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  32.4 
 
 
410 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  34.98 
 
 
425 aa  199  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  35.77 
 
 
427 aa  198  1e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  34.24 
 
 
424 aa  198  2e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  33 
 
 
411 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  36.47 
 
 
443 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  32.94 
 
 
430 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  32.62 
 
 
412 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  38.87 
 
 
420 aa  191  3e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  33.33 
 
 
436 aa  190  6e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  3.40178e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  32.86 
 
 
431 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  32.78 
 
 
432 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
454 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  32.39 
 
 
421 aa  186  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  30.86 
 
 
408 aa  180  5e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  36.44 
 
 
385 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  31.11 
 
 
411 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  31.82 
 
 
471 aa  177  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  30.14 
 
 
426 aa  176  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  32.75 
 
 
404 aa  172  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  30.46 
 
 
395 aa  164  2e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  30.41 
 
 
414 aa  164  4e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  30.14 
 
 
395 aa  164  4e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  31.51 
 
 
395 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  28.5 
 
 
407 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  27.68 
 
 
398 aa  156  8e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
418 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  30.68 
 
 
439 aa  154  3e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  34.02 
 
 
426 aa  148  2e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  29.36 
 
 
421 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  28.79 
 
 
382 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  28.79 
 
 
382 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  28.79 
 
 
382 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  28.79 
 
 
382 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>