More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0090 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
494 aa  979  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.56 
 
 
465 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.82 
 
 
447 aa  235  1e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  33.96 
 
 
445 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.52 
 
 
444 aa  199  1e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
444 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.33 
 
 
465 aa  175  2e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.19 
 
 
419 aa  115  2e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.47 
 
 
456 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  29.62 
 
 
434 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  29.22 
 
 
434 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  28.32 
 
 
450 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.67 
 
 
232 aa  97.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  32.86 
 
 
627 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.39 
 
 
448 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.08 
 
 
344 aa  94  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.84 
 
 
347 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  27.3 
 
 
443 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.64888e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.13 
 
 
752 aa  89  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0951  propane monoxygenase reductase  32.08 
 
 
353 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.56 
 
 
376 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.48 
 
 
669 aa  86.7  1e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  23.8 
 
 
481 aa  85.9  1e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  32.41 
 
 
625 aa  84.7  3e-15  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.56 
 
 
254 aa  84  5e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  29.68 
 
 
440 aa  83.6  7e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  7.00174e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.7 
 
 
261 aa  83.6  7e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  30.08 
 
 
350 aa  83.6  8e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.24 
 
 
344 aa  82.4  2e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  4.62807e-05 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.27 
 
 
346 aa  82  2e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  30.22 
 
 
339 aa  82.4  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0882  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.33 
 
 
283 aa  80.9  5e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.256079 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.62 
 
 
340 aa  80.5  7e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.99 
 
 
445 aa  79.7  1e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.43 
 
 
447 aa  79.7  1e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.7 
 
 
677 aa  79.7  1e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  29.13 
 
 
307 aa  79.7  1e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.07165e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  31.88 
 
 
353 aa  78.6  2e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0327  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.76 
 
 
295 aa  79  2e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.35697 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.58 
 
 
688 aa  77.8  4e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  32.09 
 
 
356 aa  77.8  4e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.74 
 
 
280 aa  77.4  6e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.97 
 
 
322 aa  77.4  6e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  30.08 
 
 
340 aa  77  7e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.02 
 
 
346 aa  77  7e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.9 
 
 
350 aa  76.6  8e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  26.67 
 
 
441 aa  76.6  9e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0831  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.19 
 
 
295 aa  75.9  1e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0513351  normal  0.774772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0145  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.72 
 
 
280 aa  76.3  1e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.062638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  26.19 
 
 
232 aa  76.3  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3587  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.72 
 
 
280 aa  76.3  1e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  26.92 
 
 
419 aa  76.3  1e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2541  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.3 
 
 
406 aa  76.3  1e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.97 
 
 
322 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  30.99 
 
 
339 aa  75.5  2e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.54 
 
 
322 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  29.02 
 
 
339 aa  75.1  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.97 
 
 
322 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  30.99 
 
 
339 aa  75.5  2e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  25.97 
 
 
322 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  25.97 
 
 
322 aa  75.5  2e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1138  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.81 
 
 
412 aa  75.9  2e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.97 
 
 
322 aa  75.5  2e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  30.95 
 
 
444 aa  75.9  2e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  25.77 
 
 
424 aa  74.7  3e-12  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1357  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.7 
 
 
283 aa  75.1  3e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  normal  0.34047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.6 
 
 
676 aa  74.7  3e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  26.42 
 
 
355 aa  74.7  3e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  31.25 
 
 
421 aa  74.7  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4622  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.31 
 
 
363 aa  74.3  4e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0170998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.75 
 
 
351 aa  74.7  4e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.54 
 
 
322 aa  73.9  5e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0854  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.59 
 
 
276 aa  74.3  5e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  28.01 
 
 
489 aa  74.3  5e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0869  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.74 
 
 
281 aa  73.9  6e-12  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  23.12 
 
 
407 aa  73.9  6e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  25.54 
 
 
322 aa  73.6  7e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  24.6 
 
 
419 aa  73.6  7e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  30.52 
 
 
339 aa  73.9  7e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  32.74 
 
 
346 aa  73.2  9e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  31.75 
 
 
339 aa  72.8  1e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  31.75 
 
 
339 aa  72.8  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.78 
 
 
342 aa  72.8  1e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  31.75 
 
 
339 aa  72.8  1e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  31.75 
 
 
339 aa  72.8  1e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3569  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.05 
 
 
362 aa  72.8  1e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  24.22 
 
 
348 aa  73.2  1e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.95 
 
 
342 aa  72.8  1e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1656  ferredoxin/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  27.68 
 
 
342 aa  73.2  1e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.57 
 
 
352 aa  73.2  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.83 
 
 
333 aa  72.8  1e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  31.75 
 
 
339 aa  72.8  1e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1254  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.66 
 
 
303 aa  72.8  1e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.54 
 
 
585 aa  73.2  1e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  28.31 
 
 
348 aa  73.2  1e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0026  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.23 
 
 
280 aa  72  2e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.974247  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  31.05 
 
 
338 aa  72.4  2e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  35.26 
 
 
350 aa  72.4  2e-11  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.33 
 
 
390 aa  72.4  2e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  23.12 
 
 
407 aa  72.4  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>