50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0089 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0089  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
347 aa  689    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2821  membrane-bound metal-dependent hydrolase  42.65 
 
 
349 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0774774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0189  membrane-bound metal-dependent hydrolase  43.88 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0493  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.18 
 
 
363 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1784  membrane-bound metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
365 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461872 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06039  hypothetical protein  31.72 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1149  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.4 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3169  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.2 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.2 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355245  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000244  integral membrane protein  28.98 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2186  hypothetical protein  31.38 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34740  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.28 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0633  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.78 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.153204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.71 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1308  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.45 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0104  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.84 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2700  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.89 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.91 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1338  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.55 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01789  hypothetical protein  31.12 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0041  hypothetical protein  30.32 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0040  hypothetical protein  29.86 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0683  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2680  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.89 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0173837  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3601  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.6 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04870  hypothetical protein  26.61 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1957  hypothetical protein  27.47 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1923  hypothetical protein  27.47 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1407  hypothetical protein  28.45 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3092  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.51 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00643925  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0771  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.85 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2955  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.24 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0396  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.8 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0877496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0462  membrane-bound metal-dependent hydrolase  25.17 
 
 
326 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0501  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.63 
 
 
390 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.506044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04685  integral membrane protein  41.41 
 
 
162 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4651  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.29 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493672  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0438  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.24 
 
 
326 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1546  membrane-bound metal-dependent hydrolase  29.57 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4800  yfhP protein  31.34 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000384409  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0502  yfhP protein  31.34 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0524  yfhP protein  30.6 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00408838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0521  hypothetical protein  31.34 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.724093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0577  yfhP protein  31.34 
 
 
326 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0046526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0429  hypothetical protein  31.34 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0433  hypothetical protein  31.34 
 
 
326 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000365967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0490  yfhP protein  31.34 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0576  yfhP protein  31.34 
 
 
326 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0442  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.24 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2345  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000015243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>